DMR 24977 chr1:8774901-8775050 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:8774901-8775050 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRERE (0bp away)
ANODEV p-value0.00599535226232
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
24977 RERE 171 uc001ape.3 chr1 8412464 8877699 - 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
24977 RERE 171 uc001apf.3 chr1 8412464 8877699 - 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
24977 RERE 171 uc001aph.1 chr1 8525030 8813897 - 150 100.0 0.89 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
24977 chr1 8774681 8774910 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:135, srow:7036
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
24977 cellmeth_recounts PrEC: 10, LNCaP: 16, DU145: 29
24977 cellexp id=ENSG00000142599, name=RERE, PrEC=6064, str=5062, LNCaP=2677, str=2048, DU145=3741, str=3492
24977 tcgaexp gene=RERE, entrez=473, pos=chr1:8412464-8877699(-), B=16405, L=21660, M=21844, H=23766
24977 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
24977 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305