DMR 25043 chr1:15712701-15712900 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:15712701-15712900 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesFHAD1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00217854963247
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 4.0 (66.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
25043 FHAD1 269 uc001awb.2 chr1 15573768 15724622 + 200 100.0 0.87 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (100), E31 (0) 0.0
25043 FHAD1 269 uc001awe.1 chr1 15671912 15724622 + 200 100.0 1.88 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (100), E14 (0) 0.0
25043 FHAD1 269 uc001awg.3 chr1 15707197 15726778 + 200 100.0 1.88 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25043 FHAD1 269 uc010obl.1 chr1 15671579 15724622 + 200 100.0 3.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (100), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
25043 chr1 15712681 15713315 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 43 score:542, srow:11998
25043 chr1 15712792 15712801 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:56942
25043 chr1 15712889 15712895 phastConsElements100way lod=26 score:316, srow:56943
  • 3 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
25043 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 1, DU145: 0
25043 cellexp id=ENSG00000142621, name=FHAD1, PrEC=33, str=11, LNCaP=20, str=19, DU145=122, str=134
25043 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
25043 tcgaexp gene=FHAD1, entrez=114827, pos=chr1:15573768-15726778(+), B=40, L=16, M=28, H=33
25043 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305