DMR 25131 chr1:23117101-23117350 (250bp)

DMR Stats
Positionchr1:23117101-23117350 (View on UCSC)
Width250bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesEPHB2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00445834542427
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 5.0 (83.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
25131 EPHB2 407 uc001bge.3 chr1 23037331 23241823 + 250 100.0 1.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
25131 EPHB2 407 uc001bgf.3 chr1 23037331 23241823 + 250 100.0 0.27 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
25131 EPHB2 407 uc009vqj.1 chr1 23037331 23241082 + 250 100.0 0.27 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
25131 EPHB2 407 uc010odu.2 chr1 23037332 23241823 + 250 100.0 0.36 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
25131 chr1 23117066 23117215 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 3 score:171, srow:18458
25131 chr1 23117241 23117555 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 7 score:281, srow:18459
25131 chr1 23116767 23117230 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:371, expCount:1, expNums:78, expScores:371, srow:60143
25131 chr1 23117088 23117394 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 GATA2 score:1000, expCount:1, expNums:586, expScores:1000, srow:60146
25131 chr1 23117118 23117387 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 REST score:171, expCount:1, expNums:257, expScores:171, srow:60147
25131 chr1 23117140 23117310 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EP300 score:667, expCount:1, expNums:263, expScores:667, srow:60148
25131 chr1 23117237 23117452 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RAD21 score:207, expCount:1, expNums:264, expScores:207, srow:60149
25131 chr1 23117327 23117340 tfbsConsSites V$NFY_C score:840, zScore:1.75, srow:48423
25131 chr1 23117256 23117281 phastConsElements100way lod=74 score:420, srow:90455
25131 chr1 23117284 23117294 phastConsElements100way lod=32 score:337, srow:90456
25131 chr1 23117300 23117304 phastConsElements100way lod=24 score:308, srow:90457
  • 11 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
25131 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 0
25131 cellexp id=ENSG00000133216, name=EPHB2, PrEC=413, str=2906, LNCaP=492, str=454, DU145=323, str=463
25131 tcgaexp gene=EPHB2, entrez=2048, pos=chr1:23037331-23241823(+), B=495, L=374, M=321, H=349
25131 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
25131 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305