DMR 25281 chr1:44300101-44300300 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:44300101-44300300 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesST3GAL3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0103349767729
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
25281 ST3GAL3 774 uc001cjz.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001cka.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckb.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckc.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.72 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckd.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.44 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001cke.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.88 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckf.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.2 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckg.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckh.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001cki.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckj.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.25 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckk.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckl.4 chr1 44201904 44396837 + 200 100.0 0.91 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckm.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckn.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.18 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001cko.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckp.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 1.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckq.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc001ckr.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc009vwu.1 chr1 44171495 44360149 + 200 100.0 0.31 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc009vwv.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.47 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc009vww.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.47 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc009vwx.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.27 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc009vwy.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.27 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
25281 ST3GAL3 774 uc009vwz.4 chr1 44173204 44396837 + 200 100.0 0.27 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • Page 1 of 2
  • 25 of 28 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
25281 chr1 44299941 44300550 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 59 score:1000, srow:35122
25281 chr1 44299814 44300157 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 STAT3 score:163, expCount:3, expNums:566,567,568, expScores:163,155,124, srow:125016
25281 chr1 44299906 44300190 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SPI1 score:436, expCount:3, expNums:107,126,230, expScores:270,436,132, srow:125017
25281 chr1 44299980 44300555 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 KDM5B score:253, expCount:1, expNums:31, expScores:253, srow:125018
25281 chr1 44300001 44300463 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOS score:228, expCount:2, expNums:558,590, expScores:228,177, srow:125019
25281 chr1 44300031 44300430 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 WRNIP1 score:113, expCount:1, expNums:320, expScores:113, srow:125020
25281 chr1 44300040 44300363 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 REST score:146, expCount:1, expNums:274, expScores:146, srow:125021
25281 chr1 44300043 44300638 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MYC score:354, expCount:3, expNums:487,489,575, expScores:192,354,205, srow:125022
25281 chr1 44300047 44300803 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 HDAC8 score:284, expCount:1, expNums:592, expScores:176, srow:125023
25281 chr1 44300107 44300562 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 JUND score:409, expCount:2, expNums:507,594, expScores:409,402, srow:125024
25281 chr1 44300160 44300341 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:404, expCount:1, expNums:275, expScores:404, srow:125025
25281 chr1 44300169 44300598 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 E2F6 score:168, expCount:1, expNums:495, expScores:168, srow:125026
25281 chr1 44300208 44300607 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TBL1XR1 score:176, expCount:1, expNums:543, expScores:176, srow:125027
25281 chr1 44300231 44300670 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CBX3 score:292, expCount:1, expNums:211, expScores:292, srow:125028
25281 chr1 44300235 44300490 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ATF1 score:320, expCount:1, expNums:468, expScores:320, srow:125029
25281 chr1 44300239 44300554 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 YY1 score:207, expCount:1, expNums:245, expScores:207, srow:125030
25281 chr1 44300245 44300600 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAX score:554, expCount:2, expNums:223,511, expScores:554,292, srow:125031
25281 chr1 44300254 44300569 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EP300 score:228, expCount:1, expNums:519, expScores:228, srow:125032
25281 chr1 44300276 44300505 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOSL1 score:120, expCount:1, expNums:219, expScores:120, srow:125033
25281 chr1 44300282 44300541 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SIN3AK20 score:118, expCount:1, expNums:232, expScores:118, srow:125034
25281 chr1 44300285 44300594 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 BHLHE40 score:375, expCount:1, expNums:472, expScores:375, srow:125035
25281 chr1 44300286 44300581 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 GABPA score:599, expCount:2, expNums:91,220, expScores:210,599, srow:125036
25281 chr1 44300287 44300653 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RCOR1 score:288, expCount:2, expNums:491,492, expScores:223,288, srow:125037
25281 chr1 44300298 44300647 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 STAT5A score:452, expCount:1, expNums:237, expScores:452, srow:125038
  • 24 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
25281 cellmeth_recounts PrEC: 12, LNCaP: 1, DU145: 4
25281 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=18, B=1, Length=360, Event=Down, log2FC=-4.17, padj=0.00067685324419202
25281 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=18, B=1, Length=240, Event=Down, log2FC=-4.17, padj=0.000790397688779211
25281 cellexp id=ENSG00000126091, name=ST3GAL3, PrEC=952, str=398, LNCaP=742, str=388, DU145=438, str=438
25281 tcgaexp gene=ST3GAL3, entrez=6487, pos=chr1:44171495-44396837(+), B=958, L=1208, M=1056, H=852
25281 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305