DMR 25562 chr1:144481151-144481350 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:144481151-144481350 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesNBPF8, LOC728875, NBPF9, LOC100288142 (0bp away)
ANODEV p-value0.0157188879118
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
25562 NBPF8 1460 uc001ekk.2 chr1 144190582 144830407 + 200 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
25562 LOC728875 1470 uc001eky.4 chr1 144480746 144521009 - 200 100.0 0.08 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0) 100.0
25562 LOC728875 1470 uc001ekz.4 chr1 144480746 144521969 - 200 100.0 0.02 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0) 100.0
25562 LOC728875 1470 uc001ela.4 chr1 144480745 144521009 - 200 100.0 0.02 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (100) 100.0
25562 NBPF8 1460 uc010oxn.2 chr1 144146811 144830407 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
25562 NBPF9 1460 uc010oxo.2 chr1 144146811 144830407 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
25562 NBPF8 1460 uc010oyd.2 chr1 144218499 144830407 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
25562 NBPF8 1460 uc021oth.2 chr1 144148790 144830407 + 200 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (100), E14 (0) 0.0
25562 LOC100288142 1460 uc021otj.2 chr1 144151519 144830407 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (100), E23 (0) 0.0
25562 NBPF8 1460 uc021oto.2 chr1 144176439 144830407 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (100), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
25562 NBPF8 1460 uc021otr.2 chr1 144183588 144830407 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0) 0.0
25562 LOC100288142 1460 uc021ots.1 chr1 144184252 145339512 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
25562 LOC100288142 1460 uc021ott.2 chr1 144146811 146467744 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (100), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (0), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0), I74 (0), E75 (0), I75 (0), E76 (0), I76 (0), E77 (0), I77 (0), E78 (0), I78 (0), E79 (0), I79 (0), E80 (0), I80 (0), E81 (0), I81 (0), E82 (0), I82 (0), E83 (0), I83 (0), E84 (0), I84 (0), E85 (0), I85 (0), E86 (0), I86 (0), E87 (0), I87 (0), E88 (0), I88 (0), E89 (0), I89 (0), E90 (0), I90 (0), E91 (0), I91 (0), E92 (0), I92 (0), E93 (0), I93 (0), E94 (0), I94 (0), E95 (0), I95 (0), E96 (0), I96 (0), E97 (0), I97 (0), E98 (0), I98 (0), E99 (0), I99 (0), E100 (0), I100 (0), E101 (0), I101 (0), E102 (0), I102 (0), E103 (0), I103 (0), E104 (0), I104 (0), E105 (0), I105 (0), E106 (0), I106 (0), E107 (0), I107 (0), E108 (0), I108 (0), E109 (0), I109 (0), E110 (0), I110 (0), E111 (0), I111 (0), E112 (0), I112 (0), E113 (0), I113 (0), E114 (0), I114 (0), E115 (0), I115 (0), E116 (0), I116 (0), E117 (0), I117 (0), E118 (0), I118 (0), E119 (0), I119 (0), E120 (0), I120 (0), E121 (0), I121 (0), E122 (0), I122 (0), E123 (0), I123 (0), E124 (0), I124 (0), E125 (0), I125 (0), E126 (0), I126 (0), E127 (0), I127 (0), E128 (0), I128 (0), E129 (0), I129 (0), E130 (0), I130 (0), E131 (0), I131 (0), E132 (0) 0.0
25562 LOC100288142 1460 uc021otv.1 chr1 144189012 144827928 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (100), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
  • 14 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
25562 chr1 144481123 144481711 cpgIsland CpG: 43 length:589, cpgNum:43, gcNum:370, perCpg:14.6, perGc:62.8, obsExp:0.75, srow:1522
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
25562 cellmeth_recounts PrEC: 2, LNCaP: 1, DU145: 1
25562 cellexp id=ENSG00000231360, name=AL592284.1, PrEC=10, str=4, LNCaP=5, str=2, DU145=9, str=2
25562 cellexp id=ENSG00000236943, name=RP11-640M9.1, PrEC=56, str=69, LNCaP=75, str=22, DU145=18, str=10
25562 tcgaexp gene=NBPF9, entrez=400818, pos=chr1:144146811-148346929(-), B=433, L=627, M=621, H=693
25562 tcgaexp gene=PPIAL4B, entrez=653505, pos=chr1:144363462-149553787(-), B=0, L=0, M=0, H=0
25562 tcgaexp gene=LINC00623, entrez=728855, pos=chr1:144300512-149616786(-), B=727, L=966, M=1062, H=1250
25562 tcgaexp gene=LOC728875, entrez=728875, pos=chr1:144300512-144521969(-), B=106, L=157, M=166, H=162
25562 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305