DMR 256 chr1:46379501-46379650 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:46379501-46379650 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesMAST2 (0bp away)
ANODEV p-value0.000199100705188
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
256 MAST2 820 uc001cov.3 chr1 46269285 46501796 + 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
256 MAST2 820 uc001cow.3 chr1 46269285 46501796 + 150 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
256 MAST2 820 uc001cox.1 chr1 46330050 46472067 + 150 100.0 0.2 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
256 MAST2 820 uc001coy.1 chr1 46330050 46496962 + 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
256 MAST2 820 uc001coz.1 chr1 46379260 46496433 + 150 100.0 0.16 0 100.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
256 MAST2 820 uc009vya.3 chr1 46379265 46489944 + 150 100.0 0.16 0 100.0 E1 (34), I1 (66.67), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
256 chr1 46379401 46379670 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:363, srow:36610
256 chr1 46378996 46379519 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 HDAC1 score:178, expCount:1, expNums:26, expScores:178, srow:132111
256 chr1 46379472 46379578 phastConsElements100way lod=596 score:626, srow:204687
256 chr1 46379591 46379616 phastConsElements100way lod=56 score:392, srow:204688
256 chr1 46379622 46379641 phastConsElements100way lod=22 score:300, srow:204689
  • 5 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
256 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 0
256 cellexp id=ENSG00000086015, name=MAST2, PrEC=4436, str=2822, LNCaP=3020, str=1668, DU145=4662, str=3838
256 tcgaexp gene=MAST2, entrez=23139, pos=chr1:46269285-46501796(+), B=2950, L=3984, M=4012, H=3976
256 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305