DMR 26091 chr2:25600351-25600500 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:25600351-25600500 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesDTNB (0bp away)
ANODEV p-value0.00384110943624
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 4.0 (66.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
26091 DTNB 16101 uc002rgg.4 chr2 25600067 25705742 - 150 100.0 0.3 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (52.67), E11 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc002rgh.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.55 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (52.67), E21 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc002rgi.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.55 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (52.67), E20 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc002rgj.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 1.47 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (52.67), E20 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc002rgk.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.75 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (52.67), E19 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc002rgl.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.64 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (52.67), E18 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc002rgn.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 1.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (52.67), E18 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc002rgq.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 1.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (52.67), E20 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc010yko.3 chr2 25600067 25873091 - 150 100.0 3.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (52.67), E18 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc010ykp.3 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (52.67), E18 (48) 100.0
26091 DTNB 16101 uc031rns.1 chr2 25600067 25875530 - 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (52.67), E18 (48) 100.0
  • 11 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
26091 chr2 25599686 25600515 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 125 score:1000, srow:606941
26091 chr2 25599570 25600366 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TCF7L2 score:1000, expCount:6, expNums:363,367,413,414,573,581, expScores:1000,180,256,1000,221,192, srow:2126614
26091 chr2 25599736 25600395 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MTA3 score:388, expCount:1, expNums:95, expScores:388, srow:2126659
26091 chr2 25599748 25600417 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RBBP5 score:253, expCount:1, expNums:8, expScores:253, srow:2126663
26091 chr2 25600195 25600486 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:159, expCount:2, expNums:630,635, expScores:159,126, srow:2126677
26091 chr2 25600247 25600496 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TEAD4 score:168, expCount:1, expNums:160, expScores:168, srow:2126678
26091 chr2 25600423 25600436 tfbsConsSites V$MRF2_01 score:836, zScore:1.85, srow:2571423
26091 chr2 25600354 25600359 phastConsElements100way lod=36 score:348, srow:4436185
26091 chr2 25600361 25600371 phastConsElements100way lod=60 score:399, srow:4436186
26091 chr2 25600397 25600403 phastConsElements100way lod=39 score:356, srow:4436187
26091 chr2 25600414 25600436 phastConsElements100way lod=47 score:375, srow:4436188
26091 chr2 25600443 25600448 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:4436189
26091 chr2 25599896 25601895 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:26607
  • 13 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
26091 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 15, DU145: 4
26091 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=0, B=12, Length=280, Event=Up, log2FC=Inf, padj=0.00157949948552458
26091 cellexp id=ENSG00000138101, name=DTNB, PrEC=1584, str=391, LNCaP=2754, str=1879, DU145=901, str=737
26091 tcgameth site:cg02068690, B=0.38, L=0.57, H=0.56
26091 tcgaexp gene=DTNB, entrez=1838, pos=chr2:25600067-25896516(-), B=1877, L=2242, M=2150, H=1843