DMR 26128 chr2:33500801-33500950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:33500801-33500950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesLTBP1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0103422596573
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 4.0 (66.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
26128 LTBP1 16215 uc002rou.3 chr2 33359664 33624575 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (44.67), E14 (55.33), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
26128 LTBP1 16215 uc002rov.3 chr2 33359664 33624575 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (44.67), E14 (55.33), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
26128 LTBP1 16215 uc010ymz.2 chr2 33359664 33624575 + 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (44.67), E14 (55.33), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
26128 LTBP1 16215 uc010yna.2 chr2 33359664 33624575 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (44.67), E14 (55.33), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
26128 LTBP1 16215 uc021vft.1 chr2 33172369 33624575 + 150 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (44.67), E18 (55.33), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
26128 chr2 33500841 33501175 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 93 score:1000, srow:611929
26128 chr2 33500485 33501140 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SIN3AK20 score:289, expCount:2, expNums:63,260, expScores:289,242, srow:2143532
26128 chr2 33500639 33501178 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 GABPA score:352, expCount:3, expNums:54,180,220, expScores:352,249,222, srow:2143533
26128 chr2 33500686 33501225 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EP300 score:674, expCount:4, expNums:60,190,263,519, expScores:396,548,674,380, srow:2143534
26128 chr2 33500699 33501228 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:499, expCount:3, expNums:206,259,275, expScores:361,330,499, srow:2143535
26128 chr2 33500760 33501159 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MXI1 score:216, expCount:1, expNums:441, expScores:216, srow:2143536
26128 chr2 33500764 33501043 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CREB1 score:271, expCount:1, expNums:47, expScores:271, srow:2143537
26128 chr2 33500782 33501157 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TCF7L2 score:211, expCount:1, expNums:363, expScores:211, srow:2143538
26128 chr2 33500788 33501063 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ELF1 score:275, expCount:1, expNums:217, expScores:275, srow:2143539
26128 chr2 33500788 33501187 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOS score:1000, expCount:7, expNums:457,478,556,557,558,559,590, expScores:444,271,729,970,770,1000,1000, srow:2143540
26128 chr2 33500789 33501193 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAX score:268, expCount:3, expNums:223,460,511, expScores:268,141,145, srow:2143541
26128 chr2 33500790 33501009 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ZBTB7A score:388, expCount:2, expNums:205,247, expScores:264,388, srow:2143542
26128 chr2 33500794 33501027 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOXA1 score:1000, expCount:2, expNums:177,178, expScores:1000,1000, srow:2143543
26128 chr2 33500798 33501193 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 JUNB score:368, expCount:1, expNums:593, expScores:368, srow:2143544
26128 chr2 33500799 33501163 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 BHLHE40 score:203, expCount:2, expNums:423,472, expScores:203,194, srow:2143545
26128 chr2 33500806 33501189 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 USF1 score:418, expCount:6, expNums:67,68,69,202,243,265, expScores:270,216,418,345,339,206, srow:2143546
26128 chr2 33500807 33501146 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 JUN score:898, expCount:5, expNums:458,480,482,483,484, expScores:898,196,205,145,417, srow:2143547
26128 chr2 33500809 33501128 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NR3C1 score:768, expCount:3, expNums:56,57,58, expScores:768,224,545, srow:2143548
26128 chr2 33500809 33501132 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 REST score:275, expCount:2, expNums:258,274, expScores:222,275, srow:2143549
26128 chr2 33500810 33501193 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MYC score:185, expCount:4, expNums:487,560,561,617, expScores:158,137,159,185, srow:2143550
26128 chr2 33500817 33501120 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOXP2 score:472, expCount:1, expNums:251, expScores:472, srow:2143551
26128 chr2 33500819 33501074 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ATF1 score:185, expCount:1, expNums:468, expScores:185, srow:2143552
26128 chr2 33500822 33501117 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RCOR1 score:240, expCount:1, expNums:492, expScores:240, srow:2143553
26128 chr2 33500825 33501140 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 STAT3 score:212, expCount:2, expNums:566,569, expScores:212,197, srow:2143554
26128 chr2 33500830 33501098 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOSL2 score:1000, expCount:2, expNums:52,176, expScores:1000,1000, srow:2143555
  • Page 1 of 3
  • 25 of 55 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
26128 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 8, DU145: 0
26128 cellexp id=ENSG00000049323, name=LTBP1, PrEC=7716, str=20561, LNCaP=99, str=98, DU145=822, str=1087
26128 tcgaexp gene=LTBP1, entrez=4052, pos=chr2:33172369-33624575(+), B=9489, L=7215, M=6606, H=7636