DMR 26667 chr2:218762451-218762650 (200bp)

DMR Stats
Positionchr2:218762451-218762650 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesTNS1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00286905570054
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
26667 TNS1 17576 uc002vgr.2 chr2 218664512 218784959 - 200 100.0 1.41 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (65), I5 (35), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0) 0.0
26667 TNS1 17576 uc002vgs.2 chr2 218664512 218784959 - 200 100.0 1.71 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (65), I5 (35), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
26667 TNS1 17576 uc002vgt.2 chr2 218664512 218808796 - 200 100.0 1.71 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (65), I6 (35), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0) 0.0
26667 TNS1 17576 uc002vgu.3 chr2 218723952 218768536 - 200 100.0 2.28 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (65), I3 (35), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
26667 TNS1 17576 uc002vgv.1 chr2 218762521 218843542 - 130 65.0 2.87 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (65) 100.0
26667 TNS1 17576 uc010fvj.1 chr2 218712233 218770184 - 200 100.0 3.82 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (65), I3 (35), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
26667 TNS1 17576 uc010fvk.1 chr2 218712233 218867718 - 200 100.0 0.96 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (65), I8 (35), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
26667 TNS1 17576 uc010zjv.1 chr2 218682413 218808796 - 200 100.0 2.57 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (65), I6 (35), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
  • 8 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
26667 chr2 218762586 218763415 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 22 score:1000, srow:682581
26667 chr2 218762432 218762851 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:258, expCount:1, expNums:192, expScores:258, srow:2390684
26667 chr2 218762524 218762530 tfbsConsSites V$EN1_01 score:988, zScore:2.09, srow:2973611
26667 chr2 218762529 218762545 tfbsConsSites V$YY1_01 score:897, zScore:2.37, srow:2973612
26667 chr2 218762532 218762545 tfbsConsSites V$SRF_Q6 score:869, zScore:2.66, srow:2973613
26667 chr2 218762557 218762577 tfbsConsSites V$STAT1_01 score:766, zScore:1.84, srow:2973614
26667 chr2 218762557 218762577 tfbsConsSites V$STAT3_01 score:755, zScore:1.78, srow:2973615
26667 chr2 218762559 218762566 tfbsConsSites V$ATF6_01 score:873, zScore:1.74, srow:2973616
26667 chr2 218762574 218762587 tfbsConsSites V$ELK1_02 score:876, zScore:1.89, srow:2973617
26667 chr2 218762578 218762591 tfbsConsSites V$NFKB_Q6 score:823, zScore:1.66, srow:2973618
26667 chr2 218762543 218762543 cosmic COSM1591883 srow:723062
26667 chr2 218762543 218762543 cosmic COSM1016276 srow:723063
26667 chr2 218762569 218762569 cosmic COSM380962 srow:723064
26667 chr2 218762619 218762619 cosmic COSM210008 srow:723065
26667 chr2 218762620 218762620 cosmic COSM1591882 srow:723066
26667 chr2 218762620 218762620 cosmic COSM1016277 srow:723067
26667 chr2 218762500 218762501 phastConsElements100way lod=12 score:240, srow:5144134
26667 chr2 218762516 218762535 phastConsElements100way lod=180 score:508, srow:5144135
26667 chr2 218762537 218762565 phastConsElements100way lod=339 score:570, srow:5144136
26667 chr2 218762568 218762592 phastConsElements100way lod=199 score:517, srow:5144137
26667 chr2 218762594 218762597 phastConsElements100way lod=34 score:343, srow:5144138
26667 chr2 218762602 218762616 phastConsElements100way lod=146 score:487, srow:5144139
26667 chr2 218762618 218762619 phastConsElements100way lod=32 score:337, srow:5144140
26667 chr2 218762621 218762631 phastConsElements100way lod=128 score:474, srow:5144141
26667 chr2 218762633 218762672 phastConsElements100way lod=383 score:582, srow:5144142
  • 25 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
26667 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 1
26667 cellexp id=ENSG00000079308, name=TNS1, PrEC=142, str=87, LNCaP=138, str=114, DU145=170, str=72
26667 tcgaexp gene=TNS1, entrez=7145, pos=chr2:218664512-218867718(-), B=55152, L=26450, M=23515, H=20145