DMR 268 chr1:50088201-50088350 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:50088201-50088350 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesAGBL4 (0bp away)
ANODEV p-value0.00255718816283
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
268 AGBL4 862 uc001cru.2 chr1 48998527 50489626 - 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
268 AGBL4 862 uc010omw.1 chr1 48998527 50489626 - 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
268 AGBL4 862 uc010omx.1 chr1 48998527 50489626 - 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
268 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 8
268 cellexp id=ENSG00000186094, name=AGBL4, PrEC=0, str=2, LNCaP=16, str=2, DU145=0, str=0
268 tcgaexp gene=AGBL4, entrez=84871, pos=chr1:48998527-50489626(-), B=11, L=5, M=8, H=16
268 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305