DMR 29851 chr8:38323051-38323950 (900bp)
| DMR Stats | |
|---|---|
| Position | chr8:38323051-38323950 (View on UCSC) |
| Width | 900bp |
| Genomic Context | intron |
| Nearest Genes | FGFR1 (0bp away) |
| ANODEV p-value | 7.48794998229e-09 |
| Frequencies | Benign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 4.0 (44.44 %) |
| Frequent? |
Region Count Boxplot
Region Overview
Gene Overlaps
| Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc003xlp.3 | chr8 | 38268656 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.05 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc003xlu.3 | chr8 | 38280851 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.12 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc003xlv.3 | chr8 | 38280851 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.06 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc010lwk.3 | chr8 | 38268656 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.06 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc011lbu.2 | chr8 | 38268656 | 38325363 | - | 900 | 100.0 | 0.24 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc011lbv.2 | chr8 | 38268656 | 38325363 | - | 900 | 100.0 | 0.08 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc011lbw.2 | chr8 | 38268656 | 38325363 | - | 900 | 100.0 | 0.06 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc022aua.1 | chr8 | 38268656 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.11 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc022aub.1 | chr8 | 38268656 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.08 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc022auc.1 | chr8 | 38268656 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.05 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) | 0.0 |
| 29851 | FGFR1 | 28412 | uc022aud.1 | chr8 | 38268656 | 38326352 | - | 900 | 100.0 | 0.09 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) | 0.0 |
- 11 geness
Feature Overlaps
| Dmrid | Feature Chr | Feature Start | Feature End | Set | Name | Fields |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 29851 | chr8 | 38322841 | 38326050 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 125 | score:1000, srow:1154957 |
| 29851 | chr8 | 38322740 | 38323149 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | FOSL2 | score:309, expCount:1, expNums:52, expScores:309, srow:3974199 |
| 29851 | chr8 | 38322742 | 38323141 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | FOS | score:130, expCount:1, expNums:457, expScores:130, srow:3974200 |
| 29851 | chr8 | 38322787 | 38323264 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | CTCF | score:565, expCount:46, expNums:2,12,14,16,18,37,39,42,44,290,463,598,604,605,606,636,639,640,641,642,643,644,645,646,648,650,651,652,653,655,659,660,661,663,664,665,671,672,673,674,675,676,678,682,684,685, expScores:163,125,102,356,296,126,119,95,256,113,256,565,185,158,116,110,327,219,127,404,547,243,271,439,118,189,103,187,285,130,316,198,249,131,163,197,398,156,249,221,214,192,241,325,83,290, srow:3974201 |
| 29851 | chr8 | 38322802 | 38324347 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | EZH2 | score:587, expCount:2, expNums:1,40, expScores:481,216, srow:3974202 |
| 29851 | chr8 | 38322821 | 38323303 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | POLR2A | score:581, expCount:4, expNums:275,465,599,637, expScores:581,416,484,120, srow:3974203 |
| 29851 | chr8 | 38322946 | 38323235 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | FOXA2 | score:175, expCount:1, expNums:179, expScores:175, srow:3974204 |
| 29851 | chr8 | 38322951 | 38323234 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | FOXA1 | score:338, expCount:3, expNums:177,178,271, expScores:249,338,235, srow:3974205 |
| 29851 | chr8 | 38322996 | 38323299 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | FOXP2 | score:126, expCount:1, expNums:251, expScores:126, srow:3974206 |
| 29851 | chr8 | 38323233 | 38324191 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | CHD1 | score:249, expCount:2, expNums:4,344, expScores:203,169, srow:3974207 |
| 29851 | chr8 | 38323503 | 38323938 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | MAZ | score:180, expCount:1, expNums:297, expScores:180, srow:3974208 |
| 29851 | chr8 | 38323615 | 38323890 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | EGR1 | score:496, expCount:3, expNums:87,138,216, expScores:273,263,496, srow:3974209 |
| 29851 | chr8 | 38323619 | 38323898 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | PAX5 | score:139, expCount:1, expNums:129, expScores:139, srow:3974210 |
| 29851 | chr8 | 38323659 | 38323898 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | USF1 | score:156, expCount:2, expNums:202,265, expScores:156,130, srow:3974211 |
| 29851 | chr8 | 38323729 | 38324057 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | POLR2A | score:312, expCount:1, expNums:465, expScores:312, srow:3974212 |
| 29851 | chr8 | 38323915 | 38324170 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | CEBPB | score:271, expCount:1, expNums:462, expScores:271, srow:3974213 |
| 29851 | chr8 | 38323099 | 38323114 | tfbsConsSites | V$FREAC2_01 | score:871, zScore:2.76, srow:5098503 |
| 29851 | chr8 | 38323099 | 38323114 | tfbsConsSites | V$FREAC3_01 | score:828, zScore:2.2, srow:5098504 |
| 29851 | chr8 | 38323099 | 38323114 | tfbsConsSites | V$FREAC4_01 | score:820, zScore:2.08, srow:5098505 |
| 29851 | chr8 | 38323099 | 38323114 | tfbsConsSites | V$FREAC7_01 | score:877, zScore:2.15, srow:5098506 |
| 29851 | chr8 | 38323101 | 38323113 | tfbsConsSites | V$HFH3_01 | score:926, zScore:2.22, srow:5098507 |
| 29851 | chr8 | 38323101 | 38323114 | tfbsConsSites | V$FOXO1_02 | score:885, zScore:3.1, srow:5098508 |
| 29851 | chr8 | 38323101 | 38323114 | tfbsConsSites | V$FOXO3_01 | score:951, zScore:3.87, srow:5098509 |
| 29851 | chr8 | 38323101 | 38323115 | tfbsConsSites | V$HNF3B_01 | score:913, zScore:2.68, srow:5098510 |
| 29851 | chr8 | 38323102 | 38323113 | tfbsConsSites | V$HFH1_01 | score:871, zScore:1.86, srow:5098511 |
- Page 1 of 3
- Next
- 25 of 57 featuress
Omics Overlaps
| Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
|---|---|---|---|
| 29851 | cellmeth_recounts | PrEC: 0, LNCaP: 267, DU145: 0 |  |
| 29851 | cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP | A=1, B=332, Length=2060, Event=Up, log2FC=8.38, padj=0 |  |
| 29851 | cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 | A=354.92, B=0.94, Length=2060, Event=Down, log2FC=-8.57, padj=0 |  |
| 29851 | cellexp | id=ENSG00000077782, name=FGFR1, PrEC=982, str=1177, LNCaP=705, str=358, DU145=8066, str=7450 |  |
| 29851 | tcgameth | site:cg00400221, B=0.21, L=0.6, H=0.58 |  |
| 29851 | tcgameth | site:cg13123964, B=0.22, L=0.63, H=0.61 |  |
| 29851 | tcgameth | site:cg14489594, B=0.07, L=0.22, H=0.24 |  |
| 29851 | tcgaexp | gene=FGFR1, entrez=2260, pos=chr8:38268656-38326352(-), B=7202, L=4838, M=3815, H=3749 |  |