DMR 30731 chr9:136294651-136294950 (300bp)

DMR Stats
Positionchr9:136294651-136294950 (View on UCSC)
Width300bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesADAMTS13 (0bp away)
ANODEV p-value5.66874947228e-06
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdp.4 chr9 136279459 136324508 + 300 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdq.1 chr9 136287120 136295301 + 300 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (56.33), E8 (43.67) 100.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdr.1 chr9 136287120 136310940 + 300 100.0 0.15 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cds.1 chr9 136287120 136310940 + 300 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdt.1 chr9 136287120 136324404 + 300 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdu.1 chr9 136287120 136324404 + 300 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdv.4 chr9 136287120 136324508 + 300 100.0 0.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdw.4 chr9 136287120 136324508 + 300 100.0 0.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdx.4 chr9 136287120 136324508 + 300 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
30731 ADAMTS13 30236 uc004cdy.1 chr9 136293754 136315086 + 300 100.0 0.16 1 0.0 E1 (0), I1 (56.33), E2 (43.67), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 10 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
30731 chr9 136294266 136294675 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 27 score:1000, srow:1247667
30731 chr9 136294701 136295250 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 64 score:1000, srow:1247668
30731 chr9 136294503 136295172 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RBBP5 score:168, expCount:1, expNums:8, expScores:168, srow:4270627
30731 chr9 136294551 136295150 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTBP2 score:213, expCount:1, expNums:348, expScores:213, srow:4270628
30731 chr9 136294558 136295077 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SIN3A score:197, expCount:1, expNums:357, expScores:197, srow:4270629
30731 chr9 136294614 136294937 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 BACH1 score:149, expCount:1, expNums:341, expScores:149, srow:4270630
30731 chr9 136294633 136295036 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ZBTB7A score:191, expCount:1, expNums:247, expScores:191, srow:4270631
30731 chr9 136294634 136295096 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:1000, expCount:85, expNums:2,5,12,20,24,35,37,39,42,44,48,49,137,174,213,262,290,463,493,595,597,598,601,603,604,605,606,607,609,612,615,618,621,627,628,629,630,631,635,636,638,639,640,641,642,643,644,645,646,647,648,651,652,653,654,655,656,657,658,659,660,661,662,663,664,665,666,667,668,669,671,672,673,674,675,676,677,678,679,682,683,685,686,688,689, expScores:152,554,224,293,322,115,139,122,141,294,219,188,446,674,577,113,492,354,460,1000,573,223,259,531,553,725,478,379,498,166,200,115,589,294,522,471,247,327,524,457,338,667,316,307,401,263,192,471,608,126,216,118,123,212,116,250,234,546,496,1000,317,496,870,231,432,210,160,519,194,414,226,278,701,281,605,678,610,496,448,209,162,114,409,189,102, srow:4270632
30731 chr9 136294671 136294960 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ZNF143 score:337, expCount:1, expNums:361, expScores:337, srow:4270633
30731 chr9 136294711 136294986 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EGR1 score:174, expCount:1, expNums:138, expScores:174, srow:4270634
30731 chr9 136294727 136294966 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RAD21 score:445, expCount:4, expNums:149,193,231,280, expScores:261,445,216,117, srow:4270635
30731 chr9 136294866 136295209 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 GABPA score:226, expCount:1, expNums:140, expScores:226, srow:4270636
30731 chr9 136294930 136294930 cosmic COSM1598133 srow:1220692
30731 chr9 136294739 136295236 cpgIsland CpG: 48 length:498, cpgNum:48, gcNum:329, perCpg:19.3, perGc:66.1, obsExp:0.92, srow:27229
30731 chr9 136294161 136294738 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:49338
  • 15 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
30731 cellmeth_recounts PrEC: 7, LNCaP: 648, DU145: 31
30731 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=242, B=2698, Length=2060, Event=Up, log2FC=3.48, padj=0
30731 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=236, B=24, Length=560, Event=Down, log2FC=-3.3, padj=0
30731 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=2884.28, B=46.77, Length=2120, Event=Down, log2FC=-5.95, padj=0
30731 cellexp id=ENSG00000160323, name=ADAMTS13, PrEC=110, str=331, LNCaP=1385, str=348, DU145=627, str=318
30731 tcgaexp gene=ADAMTS13, entrez=11093, pos=chr9:136279459-136324508(+), B=203, L=221, M=233, H=252