DMR Stats | |
---|---|
Position | chr11:991701-991950 (View on UCSC) |
Width | 250bp |
Genomic Context | intron |
Nearest Genes | AP2A2 (0bp away) |
ANODEV p-value | 0.0173354792509 |
Frequencies | Benign: 1.0 (14.29%), Low: 5.0 (83.33%), High: 8.0 (88.89 %) |
Frequent? |
Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
31447 | AP2A2 | 4122 | uc001lss.3 | chr11 | 925809 | 1012245 | + | 250 | 100.0 | 0.24 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) | 0.0 |
31447 | AP2A2 | 4122 | uc001lst.2 | chr11 | 925809 | 1012245 | + | 250 | 100.0 | 0.13 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) | 0.0 |
31447 | AP2A2 | 4122 | uc009yco.2 | chr11 | 925809 | 1006617 | + | 250 | 100.0 | 0.14 | 1 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) | 0.0 |
Dmrid | Feature Chr | Feature Start | Feature End | Set | Name | Fields |
---|---|---|---|---|---|---|
31447 | chr11 | 991506 | 991715 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 2 | score:272, srow:185427 |
31447 | chr11 | 991726 | 992070 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 6 | score:1000, srow:185428 |
31447 | chr11 | 991887 | 992090 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | CTCF | score:131, expCount:1, expNums:605, expScores:131, srow:642568 |
31447 | chr11 | 991209 | 993208 | cpgShore | — | values(x.gr)[overs$srow, ]:6782 |
Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
---|---|---|---|
31447 | cellmeth_recounts | PrEC: 15, LNCaP: 23, DU145: 3 | |
31447 | cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 | A=22, B=2, Length=360, Event=Down, log2FC=-3.46, padj=0.000506195974236337 | |
31447 | cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 | A=18.17, B=1.87, Length=280, Event=Down, log2FC=-3.28, padj=0.00779054669185256 | |
31447 | cellexp | id=ENSG00000183020, name=AP2A2, PrEC=6767, str=5972, LNCaP=9203, str=6154, DU145=4767, str=3691 | |
31447 | tcgaexp | gene=AP2A2, entrez=161, pos=chr11:925809-1012245(+), B=5031, L=6289, M=5700, H=5408 |