DMR 327 chr1:74966201-74966400 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:74966201-74966400 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesFPGT-TNNI3K, TNNI3K (0bp away)
ANODEV p-value0.00514553606957
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
327 FPGT-TNNI3K 1040 uc001dge.2 chr1 74663896 75010116 + 200 100.0 0.73 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (100), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
327 TNNI3K 1040 uc001dgf.2 chr1 74701071 75010116 + 200 100.0 2.98 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (100), E24 (0), I24 (0), E25 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
327 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 1
327 cellexp id=ENSG00000116783, name=TNNI3K, PrEC=1, str=5, LNCaP=0, str=0, DU145=0, str=0
327 cellexp id=ENSG00000162621, name=LRRC53, PrEC=0, str=0, LNCaP=0, str=0, DU145=0, str=0
327 cellexp id=ENSG00000259030, name=FPGT-TNNI3K, PrEC=9, str=21, LNCaP=1, str=1, DU145=9, str=10
327 tcgaexp gene=TNNI3K, entrez=51086, pos=chr1:74701071-75010116(+), B=60, L=28, M=22, H=23
327 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305