DMR 33346 chr15:79102201-79102350 (150bp)

DMR Stats
Positionchr15:79102201-79102350 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesADAMTS7 (0bp away)
ANODEV p-value0.0350663907066
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 4.0 (66.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
33346 ADAMTS7 10080 uc002bej.4 chr15 79051545 79103773 - 150 100.0 0.46 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
33346 ADAMTS7 10080 uc002bek.1 chr15 79062968 79103773 - 150 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
33346 ADAMTS7 10080 uc010und.1 chr15 79057987 79103773 - 150 100.0 0.7 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
33346 chr15 79102086 79102295 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 5 score:284, srow:414352
33346 chr15 79102326 79103475 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 95 score:1000, srow:414353
33346 chr15 79100716 79102715 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:14996
  • 3 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
33346 cellmeth_recounts PrEC: 9, LNCaP: 9, DU145: 6
33346 cellexp id=ENSG00000136378, name=ADAMTS7, PrEC=124, str=981, LNCaP=265, str=168, DU145=255, str=98
33346 tcgaexp gene=ADAMTS7, entrez=11173, pos=chr15:79051545-79103773(-), B=101, L=96, M=98, H=134