DMR 33490 chr16:1763851-1764350 (500bp)
| DMR Stats | |
|---|---|
| Position | chr16:1763851-1764350 (View on UCSC) |
| Width | 500bp |
| Genomic Context | intron |
| Nearest Genes | MAPK8IP3 (0bp away) |
| ANODEV p-value | 1.6596797936e-09 |
| Frequencies | Benign: 1.0 (14.29%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %) |
| Frequent? |
Region Count Boxplot
Region Overview
Gene Overlaps
| Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 33490 | MAPK8IP3 | 10738 | uc002cmi.1 | chr16 | 1756221 | 1797070 | + | 500 | 100.0 | 0.75 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) | 0.0 |
| 33490 | MAPK8IP3 | 10738 | uc002cmj.1 | chr16 | 1756221 | 1797276 | + | 500 | 100.0 | 1.25 | 1 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) | 0.0 |
| 33490 | MAPK8IP3 | 10738 | uc002cmk.3 | chr16 | 1756221 | 1820318 | + | 500 | 100.0 | 0.75 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0) | 0.0 |
| 33490 | MAPK8IP3 | 10738 | uc002cml.3 | chr16 | 1756221 | 1820318 | + | 500 | 100.0 | 0.83 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) | 0.0 |
| 33490 | MAPK8IP3 | 10738 | uc010uvl.2 | chr16 | 1756221 | 1820318 | + | 500 | 100.0 | 0.41 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0) | 0.0 |
| 33490 | MAPK8IP3 | 10738 | uc021tah.1 | chr16 | 1756221 | 1820318 | + | 500 | 100.0 | 0.69 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0) | 0.0 |
- 6 geness
Feature Overlaps
| Dmrid | Feature Chr | Feature Start | Feature End | Set | Name | Fields |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 33490 | chr16 | 1763381 | 1763870 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 6 | score:345, srow:428812 |
| 33490 | chr16 | 1763946 | 1764315 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 28 | score:810, srow:428813 |
| 33490 | chr16 | 1763812 | 1764457 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | POLR2A | score:1000, expCount:14, expNums:104,105,123,124,130,131,308,326,328,330,332,334,338,340, expScores:402,1000,418,449,256,400,206,873,689,226,313,243,274,523, srow:1447652 |
| 33490 | chr16 | 1763856 | 1764095 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | USF1 | score:141, expCount:1, expNums:161, expScores:141, srow:1447653 |
| 33490 | chr16 | 1763867 | 1764236 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | RUNX3 | score:258, expCount:1, expNums:109, expScores:258, srow:1447654 |
| 33490 | chr16 | 1763879 | 1764081 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | ZEB1 | score:503, expCount:1, expNums:121, expScores:503, srow:1447655 |
| 33490 | chr16 | 1763892 | 1764249 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | YY1 | score:399, expCount:3, expNums:119,128,133, expScores:399,205,364, srow:1447656 |
| 33490 | chr16 | 1763907 | 1764276 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | RELA | score:330, expCount:1, expNums:325, expScores:330, srow:1447657 |
| 33490 | chr16 | 1763963 | 1764158 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | POU2F2 | score:969, expCount:2, expNums:106,125, expScores:969,901, srow:1447658 |
| 33490 | chr16 | 1763980 | 1764451 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | TAF1 | score:153, expCount:2, expNums:115,127, expScores:121,153, srow:1447659 |
| 33490 | chr16 | 1764004 | 1764439 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | MAZ | score:173, expCount:1, expNums:297, expScores:173, srow:1447660 |
| 33490 | chr16 | 1764073 | 1764367 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | PAX5 | score:1000, expCount:4, expNums:100,101,122,129, expScores:1000,957,296,678, srow:1447661 |
| 33490 | chr16 | 1764133 | 1764396 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | EBF1 | score:354, expCount:1, expNums:86, expScores:354, srow:1447662 |
- 13 featuress
Omics Overlaps
| Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
|---|---|---|---|
| 33490 | cellmeth_recounts | PrEC: 50, LNCaP: 24, DU145: 10 |  |
| 33490 | cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP | A=138, B=14, Length=580, Event=Down, log2FC=-3.3, padj=0 |  |
| 33490 | cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 | A=138, B=14, Length=620, Event=Down, log2FC=-3.3, padj=0 |  |
| 33490 | cellexp | id=ENSG00000138834, name=MAPK8IP3, PrEC=2713, str=11563, LNCaP=3291, str=1335, DU145=1878, str=1608 |  |
| 33490 | cellexp | id=ENSG00000261399, name=LA16c-329F2.1, PrEC=0, str=0, LNCaP=0, str=1, DU145=0, str=1 |  |
| 33490 | tcgameth | site:cg01489441, B=0.79, L=0.91, H=0.92 |  |
| 33490 | tcgameth | site:cg02330721, B=0.74, L=0.85, H=0.85 |  |
| 33490 | tcgaexp | gene=MAPK8IP3, entrez=23162, pos=chr16:1756221-1820318(+), B=1811, L=1627, M=1685, H=2103 |  |