DMR Stats
Positionchr16:48135051-48135250 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesABCC12 (0bp away)
ANODEV p-value0.00476984738311
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 6.0 (100.0%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
33681 ABCC12 11383 uc002eey.1 chr16 48116884 48180385 - 200 100.0 0.34 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (100), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
33681 ABCC12 11383 uc002eez.1 chr16 48116884 48180385 - 200 100.0 0.72 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (100), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
33681 ABCC12 11383 uc002efa.1 chr16 48116884 48180385 - 200 100.0 0.97 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (100), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
33681 ABCC12 11383 uc002efb.1 chr16 48116884 48180385 - 200 100.0 0.21 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (100), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
33681 ABCC12 11383 uc002efc.1 chr16 48116884 48180681 - 200 100.0 0.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (100), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
33681 ABCC12 11383 uc002efd.1 chr16 48116884 48189929 - 200 100.0 0.63 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
33681 chr16 48135006 48135575 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 24 score:526, srow:446361
33681 chr16 48134794 48135453 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MTA3 score:426, expCount:1, expNums:95, expScores:426, srow:1519733
33681 chr16 48134820 48135449 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 STAT5A score:350, expCount:1, expNums:114, expScores:350, srow:1519734
33681 chr16 48134867 48135302 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAZ score:206, expCount:1, expNums:297, expScores:206, srow:1519735
33681 chr16 48134880 48135475 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NFATC1 score:297, expCount:1, expNums:96, expScores:297, srow:1519736
33681 chr16 48134936 48135345 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TBL1XR1 score:174, expCount:1, expNums:316, expScores:174, srow:1519737
33681 chr16 48134944 48135379 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MXI1 score:178, expCount:1, expNums:298, expScores:178, srow:1519738
33681 chr16 48134946 48135325 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CHD2 score:176, expCount:1, expNums:288, expScores:176, srow:1519739
33681 chr16 48134958 48135261 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TCF3 score:191, expCount:1, expNums:117, expScores:191, srow:1519740
33681 chr16 48134966 48135285 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SP1 score:133, expCount:1, expNums:112, expScores:133, srow:1519741
33681 chr16 48134968 48135297 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 BHLHE40 score:306, expCount:1, expNums:284, expScores:306, srow:1519742
33681 chr16 48134979 48135348 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EP300 score:198, expCount:2, expNums:99,304, expScores:123,198, srow:1519743
33681 chr16 48134991 48135259 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOS score:260, expCount:3, expNums:556,557,559, expScores:260,195,184, srow:1519744
33681 chr16 48134992 48135312 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EBF1 score:1000, expCount:2, expNums:86,292, expScores:667,1000, srow:1519745
33681 chr16 48135002 48135281 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 BCL11A score:274, expCount:1, expNums:82, expScores:274, srow:1519746
33681 chr16 48135002 48135245 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EGR1 score:553, expCount:2, expNums:87,216, expScores:553,193, srow:1519747
33681 chr16 48135008 48135283 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ATF2 score:772, expCount:1, expNums:79, expScores:772, srow:1519748
33681 chr16 48135012 48135244 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 BCL3 score:669, expCount:1, expNums:83, expScores:669, srow:1519749
33681 chr16 48135022 48135370 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RUNX3 score:1000, expCount:1, expNums:109, expScores:1000, srow:1519750
33681 chr16 48135031 48135204 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TCF12 score:550, expCount:1, expNums:116, expScores:550, srow:1519751
33681 chr16 48135033 48135275 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 BATF score:1000, expCount:1, expNums:81, expScores:1000, srow:1519752
33681 chr16 48135048 48135643 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NFIC score:417, expCount:1, expNums:97, expScores:268, srow:1519753
33681 chr16 48135056 48135265 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOXM1 score:502, expCount:1, expNums:90, expScores:502, srow:1519754
33681 chr16 48135064 48135215 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 PAX5 score:537, expCount:2, expNums:100,101, expScores:537,486, srow:1519755
33681 chr16 48135076 48135181 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 IRF4 score:455, expCount:1, expNums:92, expScores:455, srow:1519756
  • Page 1 of 2
  • 25 of 26 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
33681 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 5
33681 cellexp id=ENSG00000140798, name=ABCC12, PrEC=0, str=0, LNCaP=1, str=0, DU145=1, str=0
33681 tcgaexp gene=ABCC12, entrez=94160, pos=chr16:48116884-48189929(-), B=2, L=1, M=4, H=17