DMR Stats
Positionchr17:90301-90450 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRPH3AL (0bp away)
ANODEV p-value0.00386301989017
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
33858 RPH3AL 11877 uc002fre.2 chr17 62180 202633 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
33858 RPH3AL 11877 uc002frf.2 chr17 62180 202633 - 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
33858 RPH3AL 11877 uc010cjl.2 chr17 62180 202633 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
33858 RPH3AL 11877 uc010vpy.2 chr17 62180 177370 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
33858 RPH3AL 11877 uc021tmx.1 chr17 62180 202633 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
33858 chr17 90159 90514 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAX score:228, expCount:1, expNums:511, expScores:228, srow:1606245
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
33858 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 0, DU145: 8
33858 cellexp id=ENSG00000181031, name=RPH3AL, PrEC=139, str=116, LNCaP=825, str=593, DU145=1180, str=616
33858 tcgaexp gene=RPH3AL, entrez=9501, pos=chr17:62180-202633(-), B=579, L=622, M=682, H=475
33858 tcgaexp gene=ARHGAP27, entrez=201176, pos=chr17:86404-43511112(-), B=1570, L=1264, M=1273, H=1486