DMR 33895 chr17:993501-993650 (150bp)

DMR Stats
Positionchr17:993501-993650 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesABR (0bp away)
ANODEV p-value7.02415793855e-05
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
33895 ABR 11892 uc002fsd.4 chr17 906758 1083166 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
33895 ABR 11892 uc002fse.4 chr17 906758 1090616 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
33895 ABR 11892 uc002fsg.4 chr17 906758 1012340 - 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
33895 ABR 11892 uc002fsh.1 chr17 913969 995100 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
33895 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 3, DU145: 1
33895 cellexp id=ENSG00000159842, name=ABR, PrEC=5958, str=5449, LNCaP=7075, str=4383, DU145=7236, str=5886
33895 tcgaexp gene=ABR, entrez=29, pos=chr17:906758-1090616(-), B=5740, L=5245, M=4792, H=4366
33895 tcgaexp gene=CRHR1, entrez=1394, pos=chr17:954315-43913194(+), B=36, L=21, M=25, H=18
33895 tcgaexp gene=MAPT, entrez=4137, pos=chr17:762281-44105699(+), B=1933, L=2382, M=2487, H=2583
33895 tcgaexp gene=NSF, entrez=4905, pos=chr17:266212-44834828(+), B=3355, L=5678, M=5410, H=5700
33895 tcgaexp gene=PLEKHM1, entrez=9842, pos=chr17:128328-43568146(-), B=1993, L=1631, M=1589, H=1418
33895 tcgaexp gene=LRRC37A, entrez=9884, pos=chr17:415627-44415160(+), B=924, L=896, M=971, H=940
33895 tcgaexp gene=ARL17A, entrez=51326, pos=chr17:195721-44657088(-), B=200, L=195, M=210, H=230
33895 tcgaexp gene=LRRC37A4P, entrez=55073, pos=chr17:197706-43597889(-), B=1015, L=1512, M=1396, H=1450
33895 tcgaexp gene=SPPL2C, entrez=162540, pos=chr17:943102-43924438(+), B=0, L=0, M=0, H=0
33895 tcgaexp gene=ARHGAP27, entrez=201176, pos=chr17:86404-43511112(-), B=1570, L=1264, M=1273, H=1486
33895 tcgaexp gene=STH, entrez=246744, pos=chr17:790689-44077060(+), B=0, L=0, M=0, H=0
33895 tcgaexp gene=KANSL1, entrez=284058, pos=chr17:563498-44302740(-), B=3141, L=2594, M=2797, H=3017
33895 tcgaexp gene=LRRC37A2, entrez=474170, pos=chr17:197706-44633014(+), B=351, L=310, M=361, H=377
33895 tcgaexp gene=MAPT-AS1, entrez=100128977, pos=chr17:894694-43972879(-), B=1, L=2, M=4, H=2
33895 tcgaexp gene=MAPT-IT1, entrez=100130148, pos=chr17:891434-43976164(+), B=5, L=3, M=3, H=4