DMR Stats | |
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Position | chr17:3979401-3979550 (View on UCSC) |
Width | 150bp |
Genomic Context | 3' end |
Nearest Genes | ZZEF1 (0bp away) |
ANODEV p-value | 0.00553139658244 |
Frequencies | Benign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 6.0 (66.67 %) |
Frequent? |
Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
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33940 | ZZEF1 | 11965 | uc002fxe.3 | chr17 | 3907739 | 4046253 | - | 150 | 100.0 | 1.1 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0) | 0.0 |
33940 | ZZEF1 | 11965 | uc002fxk.1 | chr17 | 3979246 | 4046253 | - | 150 | 100.0 | 3.39 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (100) | 100.0 |
Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
---|---|---|---|
33940 | cellmeth_recounts | PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 6 | |
33940 | cellexp | id=ENSG00000074755, name=ZZEF1, PrEC=4109, str=4328, LNCaP=3734, str=3690, DU145=5212, str=4806 | |
33940 | tcgaexp | gene=CRHR1, entrez=1394, pos=chr17:954315-43913194(+), B=36, L=21, M=25, H=18 | |
33940 | tcgaexp | gene=MAPT, entrez=4137, pos=chr17:762281-44105699(+), B=1933, L=2382, M=2487, H=2583 | |
33940 | tcgaexp | gene=NSF, entrez=4905, pos=chr17:266212-44834828(+), B=3355, L=5678, M=5410, H=5700 | |
33940 | tcgaexp | gene=PLEKHM1, entrez=9842, pos=chr17:128328-43568146(-), B=1993, L=1631, M=1589, H=1418 | |
33940 | tcgaexp | gene=LRRC37A, entrez=9884, pos=chr17:415627-44415160(+), B=924, L=896, M=971, H=940 | |
33940 | tcgaexp | gene=ZZEF1, entrez=23140, pos=chr17:3907739-4046253(-), B=3607, L=3298, M=3450, H=3190 | |
33940 | tcgaexp | gene=ARL17A, entrez=51326, pos=chr17:195721-44657088(-), B=200, L=195, M=210, H=230 | |
33940 | tcgaexp | gene=LRRC37A4P, entrez=55073, pos=chr17:197706-43597889(-), B=1015, L=1512, M=1396, H=1450 | |
33940 | tcgaexp | gene=CRHR1-IT1, entrez=147081, pos=chr17:1143726-43723595(+), B=197, L=211, M=215, H=223 | |
33940 | tcgaexp | gene=SPPL2C, entrez=162540, pos=chr17:943102-43924438(+), B=0, L=0, M=0, H=0 | |
33940 | tcgaexp | gene=ARHGAP27, entrez=201176, pos=chr17:86404-43511112(-), B=1570, L=1264, M=1273, H=1486 | |
33940 | tcgaexp | gene=STH, entrez=246744, pos=chr17:790689-44077060(+), B=0, L=0, M=0, H=0 | |
33940 | tcgaexp | gene=KANSL1, entrez=284058, pos=chr17:563498-44302740(-), B=3141, L=2594, M=2797, H=3017 | |
33940 | tcgaexp | gene=MGC57346, entrez=401884, pos=chr17:1151952-43715329(+), B=601, L=581, M=566, H=598 | |
33940 | tcgaexp | gene=LRRC37A2, entrez=474170, pos=chr17:197706-44633014(+), B=351, L=310, M=361, H=377 | |
33940 | tcgaexp | gene=LOC644172, entrez=644172, pos=chr17:1188439-43679748(-), B=84, L=82, M=93, H=90 | |
33940 | tcgaexp | gene=MAPT-AS1, entrez=100128977, pos=chr17:894694-43972879(-), B=1, L=2, M=4, H=2 | |
33940 | tcgaexp | gene=MAPT-IT1, entrez=100130148, pos=chr17:891434-43976164(+), B=5, L=3, M=3, H=4 |