DMR 36500 chr1:1221901-1222050 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:1221901-1222050 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesSCNN1D (0bp away)
ANODEV p-value0.00579151887362
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 4.0 (44.44 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36500 SCNN1D 55 uc001adt.1 chr1 1215816 1227409 + 150 100.0 1.3 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
36500 SCNN1D 55 uc001adu.1 chr1 1215816 1227409 + 150 100.0 2.34 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
36500 SCNN1D 55 uc001adv.2 chr1 1217489 1227409 + 150 100.0 3.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
36500 SCNN1D 55 uc001adw.2 chr1 1217489 1227409 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
36500 SCNN1D 55 uc001adx.2 chr1 1217537 1227409 + 150 100.0 0.44 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36500 chr1 1221906 1222255 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 6 score:418, srow:513
36500 chr1 1221769 1221938 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCFL score:205, expCount:1, expNums:214, expScores:205, srow:2644
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36500 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 13, DU145: 3
36500 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=0, B=11, Length=200, Event=Up, log2FC=Inf, padj=0.00296620769710024
36500 cellexp id=ENSG00000162572, name=SCNN1D, PrEC=16, str=103, LNCaP=906, str=217, DU145=338, str=218
36500 tcgaexp gene=SCNN1D, entrez=6339, pos=chr1:1215816-1227409(+), B=98, L=161, M=171, H=191
36500 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
36500 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305