DMR 36513 chr1:2098851-2099000 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:2098851-2099000 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPRKCZ (0bp away)
ANODEV p-value0.00173918698854
FrequenciesBenign: 4.0 (57.14%), Low: 5.0 (83.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36513 PRKCZ 94 uc001aiq.3 chr1 1981909 2116834 + 150 100.0 2.2 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
36513 PRKCZ 94 uc001air.3 chr1 2005086 2116834 + 150 100.0 0.66 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
36513 PRKCZ 94 uc001ais.3 chr1 2036155 2116834 + 150 100.0 0.2 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
36513 PRKCZ 94 uc010nyw.2 chr1 2005425 2116834 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
36513 PRKCZ 94 uc010nyx.2 chr1 2076796 2116834 + 150 100.0 0.2 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36513 chr1 2098466 2098875 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:401, srow:1277
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36513 cellmeth_recounts PrEC: 11, LNCaP: 1, DU145: 5
36513 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=17, B=1, Length=320, Event=Down, log2FC=-4.09, padj=0.00122106257116317
36513 cellexp id=ENSG00000067606, name=PRKCZ, PrEC=1187, str=1283, LNCaP=1606, str=1028, DU145=964, str=723
36513 tcgameth site:cg09144608, B=0.97, L=0.97, H=0.95
36513 tcgaexp gene=PRKCZ, entrez=5590, pos=chr1:1981909-2116834(+), B=1809, L=2383, M=2268, H=1943
36513 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
36513 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305