DMR 36725 chr1:35736201-35736400 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:35736201-35736400 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesZMYM4 (0bp away)
ANODEV p-value0.00673694138222
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 2.0 (33.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36725 ZMYM4 635 uc001byt.3 chr1 35734568 35887545 + 200 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
36725 ZMYM4 635 uc001byu.3 chr1 35734568 35887545 + 200 100.0 0.27 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
36725 ZMYM4 635 uc009vuu.3 chr1 35734568 35887545 + 200 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36725 chr1 35736103 35736372 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 GTF3C2 score:308, expCount:1, expNums:546, expScores:308, srow:101751
36725 chr1 35736116 35736539 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:267, expCount:5, expNums:24,213,493,621,679, expScores:255,145,160,267,159, srow:101752
36725 chr1 35734856 35736855 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:1560
  • 3 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36725 cellmeth_recounts PrEC: 4, LNCaP: 13, DU145: 18
36725 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=0, B=14, Length=300, Event=Up, log2FC=Inf, padj=0.000506195974236337
36725 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=0, B=13.1, Length=280, Event=Up, log2FC=Inf, padj=0.00251303816158297
36725 cellexp id=ENSG00000146463, name=ZMYM4, PrEC=4161, str=4386, LNCaP=4852, str=5667, DU145=3792, str=3527
36725 tcgaexp gene=ZMYM4, entrez=9202, pos=chr1:35734568-35887545(+), B=4210, L=4176, M=4385, H=4438
36725 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305