DMR 36752 chr1:44212751-44212900 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:44212751-44212900 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesST3GAL3 (0bp away)
ANODEV p-value0.00185822830959
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36752 ST3GAL3 774 uc001cjz.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001cka.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckb.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckc.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckd.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001cke.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckf.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.3 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckg.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckh.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001cki.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckj.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.14 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckk.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckl.4 chr1 44201904 44396837 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckm.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckn.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.06 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001cko.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckp.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckq.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc001ckr.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc009vwu.1 chr1 44171495 44360149 + 150 100.0 0.4 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc009vwv.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc009vww.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.08 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc009vwx.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.06 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc009vwy.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
36752 ST3GAL3 774 uc009vwz.4 chr1 44173204 44396837 + 150 100.0 0.06 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • Page 1 of 2
  • 25 of 28 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36752 cellmeth_recounts PrEC: 4, LNCaP: 8, DU145: 14
36752 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=11, B=70, Length=740, Event=Up, log2FC=2.67, padj=3.95152187696878e-10
36752 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=74.83, B=21.51, Length=740, Event=Down, log2FC=-1.8, padj=6.14245184963143e-06
36752 cellexp id=ENSG00000126091, name=ST3GAL3, PrEC=952, str=398, LNCaP=742, str=388, DU145=438, str=438
36752 tcgaexp gene=ST3GAL3, entrez=6487, pos=chr1:44171495-44396837(+), B=958, L=1208, M=1056, H=852
36752 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305