DMR 36770 chr1:48690401-48690550 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:48690401-48690550 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesSLC5A9 (0bp away)
ANODEV p-value0.00242215040546
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36770 SLC5A9 860 uc001crn.2 chr1 48688357 48714316 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (44.67), I2 (56), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
36770 SLC5A9 860 uc001cro.2 chr1 48688357 48714316 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (44.67), I2 (56), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
36770 SLC5A9 860 uc001crp.2 chr1 48688357 48714316 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (44.67), I2 (56), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
36770 SLC5A9 860 uc010oms.1 chr1 48688357 48703519 + 150 100.0 0.04 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (44.67), I2 (56), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
36770 SLC5A9 860 uc010omt.1 chr1 48688357 48714316 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (44.67), I2 (56), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
36770 SLC5A9 860 uc010omu.1 chr1 48688357 48714316 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (44.67), I2 (56), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36770 chr1 48690397 48690406 tfbsConsSites V$CDPCR3HD_01 score:889, zScore:1.76, srow:119877
36770 chr1 48690539 48690554 tfbsConsSites V$EVI1_01 score:767, zScore:2.12, srow:119878
36770 chr1 48690405 48690405 cosmic COSM910435 srow:32208
36770 chr1 48690414 48690414 cosmic COSM79052 srow:32209
36770 chr1 48690420 48690420 cosmic COSM910436 srow:32210
36770 chr1 48690405 48690409 phastConsElements100way lod=36 score:348, srow:215494
36770 chr1 48690411 48690418 phastConsElements100way lod=65 score:407, srow:215495
36770 chr1 48690420 48690421 phastConsElements100way lod=30 score:330, srow:215496
36770 chr1 48690424 48690424 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:215497
36770 chr1 48690426 48690427 phastConsElements100way lod=34 score:343, srow:215498
36770 chr1 48690429 48690442 phastConsElements100way lod=155 score:493, srow:215499
36770 chr1 48690444 48690445 phastConsElements100way lod=45 score:370, srow:215500
36770 chr1 48690447 48690457 phastConsElements100way lod=76 score:422, srow:215501
36770 chr1 48690459 48690466 phastConsElements100way lod=131 score:476, srow:215502
36770 chr1 48690468 48690473 phastConsElements100way lod=92 score:441, srow:215503
  • 15 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36770 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 1, DU145: 0
36770 cellexp id=ENSG00000117834, name=SLC5A9, PrEC=2, str=14, LNCaP=1, str=1, DU145=1, str=2
36770 tcgaexp gene=SLC5A9, entrez=200010, pos=chr1:48688357-48714316(+), B=28, L=8, M=10, H=30
36770 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305