DMR Stats | |
---|---|
Position | chr1:49849951-49850100 (View on UCSC) |
Width | 150bp |
Genomic Context | intron |
Nearest Genes | AGBL4 (0bp away) |
ANODEV p-value | 0.00252934777427 |
Frequencies | Benign: 2.0 (28.57%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %) |
Frequent? |
Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
36772 | AGBL4 | 862 | uc001cru.2 | chr1 | 48998527 | 50489626 | - | 150 | 100.0 | 0.04 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) | 0.0 |
36772 | AGBL4 | 862 | uc010omw.1 | chr1 | 48998527 | 50489626 | - | 150 | 100.0 | 0.05 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) | 0.0 |
36772 | AGBL4 | 862 | uc010omx.1 | chr1 | 48998527 | 50489626 | - | 150 | 100.0 | 0.05 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) | 0.0 |
Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
---|---|---|---|
36772 | cellmeth_recounts | PrEC: 0, LNCaP: 4, DU145: 1 | |
36772 | cellexp | id=ENSG00000186094, name=AGBL4, PrEC=0, str=2, LNCaP=16, str=2, DU145=0, str=0 | |
36772 | cellexp | id=ENSG00000225623, name=AGBL4-IT1, PrEC=0, str=0, LNCaP=0, str=0, DU145=0, str=0 | |
36772 | tcgaexp | gene=AGBL4, entrez=84871, pos=chr1:48998527-50489626(-), B=11, L=5, M=8, H=16 | |
36772 | tcgaexp | gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305 |