DMR 36774 chr1:51768101-51768250 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:51768101-51768250 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesTTC39A (0bp away)
ANODEV p-value0.000481649500074
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36774 TTC39A 871 uc001csk.3 chr1 51752930 51787938 - 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
36774 TTC39A 871 uc001csl.3 chr1 51752930 51787938 - 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
36774 TTC39A 871 uc001csn.3 chr1 51761210 51796234 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
36774 TTC39A 871 uc001cso.1 chr1 51762903 51796999 - 150 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0) 0.0
36774 TTC39A 871 uc009vyy.1 chr1 51767244 51796617 - 150 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 95.33
36774 TTC39A 871 uc010ond.2 chr1 51752930 51795845 - 150 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
36774 TTC39A 871 uc010one.2 chr1 51752930 51796234 - 150 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
36774 TTC39A 871 uc010onf.2 chr1 51752930 51810785 - 150 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 8 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36774 chr1 51767966 51768115 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 3 score:328, srow:39138
36774 chr1 51768206 51768415 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:256, srow:39139
36774 chr1 51768190 51768202 tfbsConsSites V$AREB6_01 score:884, zScore:1.75, srow:127850
36774 chr1 51768232 51768244 tfbsConsSites V$IK1_01 score:879, zScore:2.22, srow:127851
36774 chr1 51768232 51768244 tfbsConsSites V$IK3_01 score:931, zScore:3.26, srow:127852
36774 chr1 51768171 51768171 cosmic COSM36808 srow:32724
36774 chr1 51768233 51768233 cosmic COSM1343281 srow:32725
36774 chr1 51768233 51768233 cosmic COSM1343282 srow:32726
36774 chr1 51768117 51768118 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:227911
36774 chr1 51768171 51768186 phastConsElements100way lod=130 score:475, srow:227912
36774 chr1 51768191 51768201 phastConsElements100way lod=105 score:454, srow:227913
36774 chr1 51768206 51768206 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:227914
36774 chr1 51768209 51768210 phastConsElements100way lod=38 score:354, srow:227915
36774 chr1 51768213 51768216 phastConsElements100way lod=43 score:366, srow:227916
36774 chr1 51768218 51768219 phastConsElements100way lod=35 score:345, srow:227917
36774 chr1 51768221 51768225 phastConsElements100way lod=36 score:348, srow:227918
36774 chr1 51768227 51768234 phastConsElements100way lod=53 score:387, srow:227919
36774 chr1 51768236 51768237 phastConsElements100way lod=22 score:300, srow:227920
36774 chr1 51768239 51768240 phastConsElements100way lod=28 score:323, srow:227921
36774 chr1 51768242 51768243 phastConsElements100way lod=32 score:337, srow:227922
36774 chr1 51768245 51768247 phastConsElements100way lod=44 score:368, srow:227923
  • 21 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36774 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 0, DU145: 0
36774 cellexp id=ENSG00000085831, name=TTC39A, PrEC=67, str=178, LNCaP=1099, str=1415, DU145=462, str=464
36774 tcgaexp gene=TTC39A, entrez=22996, pos=chr1:51752930-51810785(-), B=3376, L=4673, M=4194, H=3516
36774 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305
36774 pubmed gene=TTC39A, G=1, GP=0, GC=1, GM=0, GPM=0, GCM=0