DMR 36812 chr1:78288701-78288850 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:78288701-78288850 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesFAM73A (0bp away)
ANODEV p-value0.0153889700652
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 1.0 (16.67%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36812 FAM73A 1062 uc001dhx.4 chr1 78245309 78345225 + 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
36812 FAM73A 1062 uc001dhy.1 chr1 78268955 78327860 + 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
36812 FAM73A 1062 uc010ork.3 chr1 78245309 78345225 + 150 100.0 0.49 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
36812 FAM73A 1062 uc010orl.3 chr1 78245309 78345225 + 150 100.0 0.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36812 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 5, DU145: 5
36812 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=1, B=16, Length=200, Event=Up, log2FC=4, padj=0.00241302194969176
36812 cellexp id=ENSG00000180488, name=FAM73A, PrEC=2248, str=3876, LNCaP=1973, str=2355, DU145=1399, str=1707
36812 tcgaexp gene=FAM73A, entrez=374986, pos=chr1:78245309-78345225(+), B=1702, L=1988, M=2105, H=2161
36812 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305