DMR 36843 chr1:116932301-116932450 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:116932301-116932450 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesATP1A1 (0bp away)
ANODEV p-value0.000444141261223
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36843 ATP1A1 1388 uc001ege.3 chr1 116915795 116947396 + 150 100.0 1.38 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (19.33), I8 (81.33), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
36843 ATP1A1 1388 uc010owv.1 chr1 116915004 116946597 + 150 100.0 21.0 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (19.33), I8 (81.33), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
36843 ATP1A1 1388 uc010oww.2 chr1 116916489 116947396 + 150 100.0 2.71 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (19.33), I8 (81.33), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
36843 ATP1A1 1388 uc010owx.2 chr1 116925992 116947396 + 150 100.0 15.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (19.33), I8 (81.33), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36843 chr1 116932154 116932353 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:226, expCount:1, expNums:627, expScores:226, srow:228386
36843 chr1 116932326 116932601 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 USF2 score:203, expCount:1, expNums:319, expScores:203, srow:228387
36843 chr1 116932289 116932306 tfbsConsSites V$RFX1_02 score:813, zScore:1.68, srow:278050
36843 chr1 116932328 116932337 tfbsConsSites V$NCX_01 score:903, zScore:2.47, srow:278051
36843 chr1 116932300 116932304 phastConsElements100way lod=72 score:417, srow:485130
36843 chr1 116932306 116932310 phastConsElements100way lod=84 score:432, srow:485131
36843 chr1 116932313 116932322 phastConsElements100way lod=114 score:462, srow:485132
36843 chr1 116932324 116932338 phastConsElements100way lod=165 score:499, srow:485133
  • 8 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36843 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 3, DU145: 0
36843 cellexp id=ENSG00000163399, name=ATP1A1, PrEC=38127, str=46875, LNCaP=24742, str=25775, DU145=21311, str=19351
36843 tcgaexp gene=ATP1A1, entrez=476, pos=chr1:116915004-116947396(+), B=54793, L=44752, M=47215, H=42592
36843 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305
36843 pubmed gene=ATP1A1, G=242, GP=0, GC=23, GM=8, GPM=0, GCM=0