DMR 36940 chr1:202506301-202506450 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:202506301-202506450 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPPP1R12B (0bp away)
ANODEV p-value0.00549029066235
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 0.0 (0.0%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36940 PPP1R12B 2384 uc001gya.2 chr1 202317830 202557697 + 150 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (100), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
36940 PPP1R12B 2384 uc001gyb.1 chr1 202431871 202557697 + 150 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
36940 PPP1R12B 2384 uc001gyc.1 chr1 202431871 202557697 + 150 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36940 chr1 202506388 202506677 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CEBPB score:199, expCount:2, expNums:426,477, expScores:199,197, srow:344955
36940 chr1 202506435 202506637 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOXA1 score:596, expCount:2, expNums:177,178, expScores:376,596, srow:344956
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36940 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 1, DU145: 6
36940 cellexp id=ENSG00000077157, name=PPP1R12B, PrEC=750, str=1098, LNCaP=949, str=1563, DU145=902, str=701
36940 tcgaexp gene=PPP1R12B, entrez=4660, pos=chr1:202317830-202557697(+), B=30536, L=15775, M=13109, H=11573