DMR 37007 chr1:227163001-227163150 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:227163001-227163150 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesADCK3 (0bp away)
ANODEV p-value0.00550314165621
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37007 ADCK3 2643 uc001hqm.1 chr1 227084589 227175246 + 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
37007 ADCK3 2643 uc001hqn.1 chr1 227127938 227175246 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
37007 ADCK3 2643 uc009xeq.1 chr1 227127938 227175246 + 150 100.0 0.46 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
37007 ADCK3 2643 uc010pvq.1 chr1 227127938 227175246 + 150 100.0 0.35 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
37007 ADCK3 2643 uc010pvr.1 chr1 227153372 227175246 + 150 100.0 0.35 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37007 chr1 227161740 227163739 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:4178
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37007 cellmeth_recounts PrEC: 7, LNCaP: 3, DU145: 4
37007 cellexp id=ENSG00000163050, name=ADCK3, PrEC=389, str=304, LNCaP=8696, str=8679, DU145=830, str=653
37007 tcgaexp gene=ADCK3, entrez=56997, pos=chr1:227084589-227175246(+), B=4622, L=6253, M=5729, H=5109