DMR 37070 chr2:1133801-1133950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:1133801-1133950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesSNTG2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00516299250176
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37070 SNTG2 15968 uc002qwp.3 chr2 946554 1157357 + 150 100.0 0.63 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0) 0.0
37070 SNTG2 15968 uc002qwq.3 chr2 946554 1371384 + 150 100.0 0.63 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
37070 SNTG2 15968 uc010ewi.3 chr2 946554 1371384 + 150 100.0 0.63 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37070 chr2 1133661 1133915 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:197, srow:593654
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37070 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 0
37070 cellexp id=ENSG00000172554, name=SNTG2, PrEC=0, str=0, LNCaP=10, str=12, DU145=54, str=25
37070 tcgameth site:cg10325383, B=0.74, L=0.83, H=0.77
37070 tcgameth site:cg16649723, B=0.84, L=0.87, H=0.86
37070 tcgaexp gene=SNTG2, entrez=54221, pos=chr2:946554-1371384(+), B=14, L=7, M=11, H=10