DMR 37071 chr2:1165351-1165500 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:1165351-1165500 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesSNTG2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00674800774474
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37071 SNTG2 15968 uc002qwq.3 chr2 946554 1371384 + 150 100.0 0.63 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
37071 SNTG2 15968 uc010ewi.3 chr2 946554 1371384 + 150 100.0 0.63 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37071 chr2 1163821 1165820 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:26285
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37071 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 1, DU145: 0
37071 cellexp id=ENSG00000172554, name=SNTG2, PrEC=0, str=0, LNCaP=10, str=12, DU145=54, str=25
37071 tcgaexp gene=SNTG2, entrez=54221, pos=chr2:946554-1371384(+), B=14, L=7, M=11, H=10