DMR 37109 chr2:15307201-15307400 (200bp)
| DMR Stats | |
|---|---|
| Position | chr2:15307201-15307400 (View on UCSC) |
| Width | 200bp |
| Genomic Context | 3' end |
| Nearest Genes | NBAS (0bp away) |
| ANODEV p-value | 0.000853981831125 |
| Frequencies | Benign: 1.0 (14.29%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %) |
| Frequent? |
Region Count Boxplot
Region Overview
Gene Overlaps
| Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 37109 | NBAS | 16044 | uc002rcb.1 | chr2 | 15307032 | 15378818 | - | 200 | 100.0 | 0.37 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (100) | 100.0 |
| 37109 | NBAS | 16044 | uc002rcc.2 | chr2 | 15307032 | 15701472 | - | 200 | 100.0 | 2.84 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (100) | 100.0 |
| 37109 | NBAS | 16044 | uc002rcd.2 | chr2 | 15307032 | 15701472 | - | 200 | 100.0 | 0.9 | 1 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (100) | 100.0 |
| 37109 | NBAS | 16044 | uc010exl.1 | chr2 | 15307032 | 15564592 | - | 200 | 100.0 | 0.33 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (100) | 100.0 |
- 4 geness
Feature Overlaps
| Dmrid | Feature Chr | Feature Start | Feature End | Set | Name | Fields |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 37109 | chr2 | 15307386 | 15307715 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 4 | score:130, srow:601793 |
| 37109 | chr2 | 15307190 | 15307210 | tfbsConsSites | V$NRSF_01 | score:711, zScore:1.73, srow:2540987 |
| 37109 | chr2 | 15307223 | 15307236 | tfbsConsSites | V$NFKB_Q6 | score:860, zScore:2.25, srow:2540988 |
| 37109 | chr2 | 15307223 | 15307237 | tfbsConsSites | V$BACH1_01 | score:800, zScore:1.79, srow:2540989 |
| 37109 | chr2 | 15307224 | 15307234 | tfbsConsSites | V$NFE2_01 | score:858, zScore:1.64, srow:2540990 |
| 37109 | chr2 | 15307225 | 15307235 | tfbsConsSites | V$BACH2_01 | score:878, zScore:1.91, srow:2540991 |
| 37109 | chr2 | 15307282 | 15307296 | tfbsConsSites | V$E47_01 | score:899, zScore:2.33, srow:2540992 |
| 37109 | chr2 | 15307388 | 15307404 | tfbsConsSites | V$RFX1_01 | score:834, zScore:1.99, srow:2540993 |
| 37109 | chr2 | 15307250 | 15307250 | cosmic | COSM362921 | srow:632095 |
| 37109 | chr2 | 15307323 | 15307323 | cosmic | COSM1216683 | srow:632096 |
| 37109 | chr2 | 15307380 | 15307380 | cosmic | COSM375686 | srow:632097 |
| 37109 | chr2 | 15307383 | 15307383 | cosmic | COSM1400107 | srow:632098 |
| 37109 | chr2 | 15307197 | 15307201 | phastConsElements100way | lod=60 | score:399, srow:4400064 |
| 37109 | chr2 | 15307203 | 15307228 | phastConsElements100way | lod=150 | score:489, srow:4400065 |
| 37109 | chr2 | 15307230 | 15307231 | phastConsElements100way | lod=28 | score:323, srow:4400066 |
| 37109 | chr2 | 15307233 | 15307237 | phastConsElements100way | lod=20 | score:290, srow:4400067 |
| 37109 | chr2 | 15307242 | 15307246 | phastConsElements100way | lod=40 | score:359, srow:4400068 |
| 37109 | chr2 | 15307248 | 15307252 | phastConsElements100way | lod=54 | score:388, srow:4400069 |
| 37109 | chr2 | 15307254 | 15307255 | phastConsElements100way | lod=38 | score:354, srow:4400070 |
| 37109 | chr2 | 15307257 | 15307258 | phastConsElements100way | lod=26 | score:316, srow:4400071 |
| 37109 | chr2 | 15307260 | 15307267 | phastConsElements100way | lod=79 | score:426, srow:4400072 |
| 37109 | chr2 | 15307272 | 15307276 | phastConsElements100way | lod=44 | score:368, srow:4400073 |
| 37109 | chr2 | 15307278 | 15307279 | phastConsElements100way | lod=22 | score:300, srow:4400074 |
| 37109 | chr2 | 15307287 | 15307291 | phastConsElements100way | lod=34 | score:343, srow:4400075 |
| 37109 | chr2 | 15307296 | 15307306 | phastConsElements100way | lod=61 | score:400, srow:4400076 |
- Page 1 of 2
- Next
- 25 of 35 featuress
Omics Overlaps
| Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
|---|---|---|---|
| 37109 | cellmeth_recounts | PrEC: 6, LNCaP: 0, DU145: 1 |  |
| 37109 | cellexp | id=ENSG00000151779, name=NBAS, PrEC=4064, str=5220, LNCaP=1528, str=1766, DU145=3949, str=2887 |  |
| 37109 | tcgaexp | gene=NBAS, entrez=51594, pos=chr2:15307032-15701472(-), B=3164, L=3208, M=3159, H=3057 |  |
| 37109 | pubmed | gene=NBAS, G=160, GP=0, GC=7, GM=0, GPM=0, GCM=0 |  |