DMR 37224 chr2:101587401-101587550 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:101587401-101587550 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesNPAS2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00172510152855
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 0.0 (0.0%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37224 NPAS2 16752 uc002tap.1 chr2 101436613 101613287 + 150 100.0 0.92 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (34), E12 (56.67), I12 (10), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
37224 NPAS2 16752 uc010yvt.1 chr2 101437487 101613287 + 150 100.0 0.92 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (34), E12 (56.67), I12 (10), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37224 chr2 101587466 101587655 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:315, srow:638770
37224 chr2 101587456 101587456 cosmic COSM1185971 srow:663769
37224 chr2 101587484 101587484 cosmic COSM1004493 srow:663770
37224 chr2 101587519 101587519 cosmic COSM138314 srow:663771
37224 chr2 101587440 101587442 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:4698823
37224 chr2 101587449 101587454 phastConsElements100way lod=72 score:417, srow:4698824
37224 chr2 101587456 101587457 phastConsElements100way lod=30 score:330, srow:4698825
37224 chr2 101587459 101587466 phastConsElements100way lod=80 score:427, srow:4698826
37224 chr2 101587468 101587499 phastConsElements100way lod=264 score:545, srow:4698827
37224 chr2 101587510 101587514 phastConsElements100way lod=41 score:361, srow:4698828
37224 chr2 101587519 101587526 phastConsElements100way lod=19 score:285, srow:4698829
37224 chr2 101587532 101587539 phastConsElements100way lod=88 score:437, srow:4698830
  • 12 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37224 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 0, DU145: 0
37224 cellexp id=ENSG00000170485, name=NPAS2, PrEC=2465, str=5325, LNCaP=189, str=181, DU145=464, str=458
37224 tcgaexp gene=NPAS2, entrez=4862, pos=chr2:101436613-101613287(+), B=1231, L=1737, M=1440, H=1486