DMR 37360 chr2:236965451-236965600 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:236965451-236965600 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesAGAP1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0119512284032
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 2.0 (33.33%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37360 AGAP1 17773 uc002vvs.3 chr2 236402733 237040444 + 150 100.0 0.27 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (100), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
37360 AGAP1 17773 uc002vvt.3 chr2 236402733 237040444 + 150 100.0 0.41 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37360 chr2 236965399 236965562 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:104, expCount:1, expNums:609, expScores:104, srow:2423774
37360 chr2 236965399 236965638 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RAD21 score:332, expCount:1, expNums:149, expScores:332, srow:2423775
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37360 cellmeth_recounts PrEC: 5, LNCaP: 1, DU145: 0
37360 cellexp id=ENSG00000157985, name=AGAP1, PrEC=1800, str=1191, LNCaP=1006, str=728, DU145=2922, str=2663
37360 tcgaexp gene=AGAP1, entrez=116987, pos=chr2:236402733-237040444(+), B=892, L=1169, M=1299, H=1351