DMR 37368 chr2:238626001-238626250 (250bp)

DMR Stats
Positionchr2:238626001-238626250 (View on UCSC)
Width250bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesLRRFIP1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00080702827034
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37368 LRRFIP1 17787 uc002vxc.3 chr2 238536224 238690290 + 250 100.0 0.62 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
37368 LRRFIP1 17787 uc002vxd.3 chr2 238600807 238674558 + 250 100.0 0.62 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
37368 LRRFIP1 17787 uc002vxe.3 chr2 238600807 238674558 + 250 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
37368 LRRFIP1 17787 uc002vxf.3 chr2 238600807 238674558 + 250 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
37368 LRRFIP1 17787 uc010znm.2 chr2 238600807 238690290 + 250 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37368 chr2 238625921 238626390 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 13 score:363, srow:694404
37368 chr2 238626149 238626165 tfbsConsSites V$PPARG_03 score:797, zScore:2.11, srow:3022969
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37368 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 4, DU145: 4
37368 cellexp id=ENSG00000124831, name=LRRFIP1, PrEC=15766, str=12338, LNCaP=8512, str=11561, DU145=10675, str=10999
37368 tcgaexp gene=LRRFIP1, entrez=9208, pos=chr2:238536224-238690290(+), B=9079, L=10107, M=9997, H=10885
37368 pubmed gene=LRRFIP1, G=33, GP=0, GC=8, GM=0, GPM=0, GCM=0