DMR 37369 chr2:238667801-238668000 (200bp)

DMR Stats
Positionchr2:238667801-238668000 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesLRRFIP1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00152672404524
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37369 LRRFIP1 17787 uc002vxc.3 chr2 238536224 238690290 + 200 100.0 0.48 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (100), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
37369 LRRFIP1 17787 uc002vxd.3 chr2 238600807 238674558 + 200 100.0 0.48 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
37369 LRRFIP1 17787 uc002vxe.3 chr2 238600807 238674558 + 200 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
37369 LRRFIP1 17787 uc002vxf.3 chr2 238600807 238674558 + 200 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
37369 LRRFIP1 17787 uc010znm.2 chr2 238600807 238690290 + 200 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37369 chr2 238667926 238668215 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 5 score:597, srow:694460
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37369 cellmeth_recounts PrEC: 5, LNCaP: 1, DU145: 0
37369 cellexp id=ENSG00000124831, name=LRRFIP1, PrEC=15766, str=12338, LNCaP=8512, str=11561, DU145=10675, str=10999
37369 tcgaexp gene=LRRFIP1, entrez=9208, pos=chr2:238536224-238690290(+), B=9079, L=10107, M=9997, H=10885