DMR 37511 chr3:50491351-50491500 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:50491351-50491500 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCACNA2D2 (0bp away)
ANODEV p-value0.0357293202912
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 2.0 (33.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37511 CACNA2D2 20201 uc003dap.3 chr3 50400231 50540892 - 150 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0) 0.0
37511 CACNA2D2 20201 uc003daq.3 chr3 50400231 50540892 - 150 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37511 chr3 50491326 50491695 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 18 score:520, srow:806626
37511 chr3 50491436 50491449 tfbsConsSites V$ELK1_02 score:867, zScore:1.74, srow:3362634
37511 chr3 50491459 50491469 tfbsConsSites V$NFY_Q6 score:970, zScore:2.32, srow:3362635
37511 chr3 50491467 50491482 tfbsConsSites V$TAL1BETAE47_01 score:871, zScore:2.21, srow:3362636
37511 chr3 50491467 50491482 tfbsConsSites V$TAL1BETAITF2_01 score:899, zScore:2.58, srow:3362637
37511 chr3 50491475 50491485 tfbsConsSites V$NFY_Q6 score:974, zScore:2.38, srow:3362638
37511 chr3 50491347 50491352 phastConsElements100way lod=35 score:345, srow:5825488
37511 chr3 50491357 50491370 phastConsElements100way lod=28 score:323, srow:5825489
37511 chr3 50491377 50491386 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:5825490
37511 chr3 50491416 50491420 phastConsElements100way lod=15 score:262, srow:5825491
37511 chr3 50491438 50491442 phastConsElements100way lod=19 score:285, srow:5825492
37511 chr3 50491445 50491567 phastConsElements100way lod=692 score:641, srow:5825493
  • 12 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37511 cellmeth_recounts PrEC: 4, LNCaP: 1, DU145: 1
37511 cellexp id=ENSG00000007402, name=CACNA2D2, PrEC=14, str=27, LNCaP=581, str=251, DU145=588, str=682
37511 tcgaexp gene=CACNA2D2, entrez=9254, pos=chr3:50400231-50540892(-), B=762, L=1212, M=1109, H=1037