DMR 37722 chr3:197598201-197598350 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:197598201-197598350 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesLRCH3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0015462104104
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37722 LRCH3 21238 uc003fyj.1 chr3 197518145 197598456 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (100) 100.0
37722 LRCH3 21238 uc003fyk.2 chr3 197556435 197611043 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (88.67), I14 (12), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
37722 LRCH3 21238 uc011bul.1 chr3 197518145 197611043 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (88.67), I19 (12), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
37722 LRCH3 21238 uc011bum.1 chr3 197518145 197611043 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (88.67), I18 (12), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
37722 LRCH3 21238 uc011bun.1 chr3 197518145 197611043 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (88.67), I16 (12), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37722 chr3 197598193 197598208 tfbsConsSites V$GRE_C score:818, zScore:1.86, srow:3677512
37722 chr3 197598255 197598283 tfbsConsSites V$MYOGNF1_01 score:783, zScore:2.48, srow:3677513
37722 chr3 197598275 197598285 tfbsConsSites V$NFY_Q6 score:957, zScore:2.12, srow:3677514
37722 chr3 197598282 197598301 tfbsConsSites V$PPARA_01 score:740, zScore:1.76, srow:3677515
37722 chr3 197598238 197598238 cosmic COSM1650144 srow:877480
37722 chr3 197598238 197598238 cosmic COSM1650145 srow:877481
37722 chr3 197598238 197598238 cosmic COSM583331 srow:877482
37722 chr3 197598255 197598255 cosmic COSM1043208 srow:877483
37722 chr3 197598258 197598258 cosmic COSM1043209 srow:877484
37722 chr3 197598320 197598320 cosmic COSM1647629 srow:877485
37722 chr3 197598320 197598320 cosmic COSM1647630 srow:877486
37722 chr3 197598320 197598320 cosmic COSM730446 srow:877487
37722 chr3 197598194 197598221 phastConsElements100way lod=251 score:540, srow:6350791
37722 chr3 197598223 197598236 phastConsElements100way lod=110 score:459, srow:6350792
37722 chr3 197598238 197598251 phastConsElements100way lod=139 score:482, srow:6350793
37722 chr3 197598253 197598257 phastConsElements100way lod=71 score:415, srow:6350794
37722 chr3 197598259 197598290 phastConsElements100way lod=291 score:555, srow:6350795
37722 chr3 197598292 197598296 phastConsElements100way lod=58 score:395, srow:6350796
37722 chr3 197598298 197598314 phastConsElements100way lod=164 score:498, srow:6350797
37722 chr3 197598316 197598317 phastConsElements100way lod=37 score:351, srow:6350798
37722 chr3 197598319 197598323 phastConsElements100way lod=50 score:381, srow:6350799
37722 chr3 197598325 197598332 phastConsElements100way lod=97 score:446, srow:6350800
37722 chr3 197598334 197598339 phastConsElements100way lod=87 score:436, srow:6350801
  • 23 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37722 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 3, DU145: 1
37722 cellexp id=ENSG00000186001, name=LRCH3, PrEC=2490, str=2963, LNCaP=1695, str=2034, DU145=3157, str=3050
37722 tcgaexp gene=LRCH3, entrez=84859, pos=chr3:197518145-197611043(+), B=1068, L=977, M=966, H=1075