DMR 37856 chr4:87970801-87970950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr4:87970801-87970950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesAFF1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00114132622714
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 1.0 (16.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37856 AFF1 21829 uc003hqh.2 chr4 87856154 88012981 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
37856 AFF1 21829 uc003hqj.4 chr4 87928153 88062206 + 150 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
37856 AFF1 21829 uc003hqk.4 chr4 87928153 88062206 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
37856 AFF1 21829 uc011ccy.2 chr4 87856154 88026834 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
37856 AFF1 21829 uc011ccz.2 chr4 87856154 88062206 + 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
37856 AFF1 21829 uc011cda.2 chr4 87928153 88062206 + 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37856 chr4 87970721 87970910 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 6 score:201, srow:894241
37856 chr4 87970868 87970885 tfbsConsSites V$AP4_01 score:814, zScore:1.71, srow:3821708
37856 chr4 87970870 87970881 tfbsConsSites V$LMO2COM_01 score:952, zScore:2.18, srow:3821709
37856 chr4 87970870 87970881 tfbsConsSites V$MYOD_01 score:885, zScore:1.67, srow:3821710
37856 chr4 87970883 87970892 tfbsConsSites V$MYB_Q6 score:980, zScore:2.94, srow:3821711
37856 chr4 87970885 87970894 tfbsConsSites V$HMX1_01 score:810, zScore:1.68, srow:3821712
37856 chr4 87970872 87970878 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:6591072
  • 7 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37856 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 3, DU145: 0
37856 cellexp id=ENSG00000172493, name=AFF1, PrEC=4139, str=9251, LNCaP=3249, str=6249, DU145=4517, str=3538
37856 tcgaexp gene=AFF1, entrez=4299, pos=chr4:87856154-88062206(+), B=6986, L=7671, M=7803, H=8742
37856 tcgaexp gene=DUX4L5, entrez=653545, pos=chr4:72836-191010142(+), B=0, L=0, M=0, H=0