DMR 38111 chr5:149227701-149227850 (150bp)

DMR Stats
Positionchr5:149227701-149227850 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesPPARGC1B (0bp away)
ANODEV p-value0.00707203841273
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 1.0 (16.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
38111 PPARGC1B 23296 uc003lrc.3 chr5 149109815 149234585 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 0.0
38111 PPARGC1B 23296 uc003lrd.3 chr5 149109815 149234585 + 150 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (100) 0.0
38111 PPARGC1B 23296 uc003lrf.3 chr5 149197327 149234585 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 0.0
38111 PPARGC1B 23296 uc021yfr.1 chr5 149151503 149234585 + 150 100.0 0.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (100) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
38111 chr5 149227723 149227725 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:7367867
38111 chr5 149227791 149227793 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:7367868
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
38111 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 1
38111 cellexp id=ENSG00000155846, name=PPARGC1B, PrEC=1166, str=416, LNCaP=389, str=712, DU145=791, str=768
38111 tcgaexp gene=PPARGC1B, entrez=133522, pos=chr5:149109815-149234585(+), B=141, L=59, M=70, H=57