DMR 38383 chr6:144652701-144652900 (200bp)

DMR Stats
Positionchr6:144652701-144652900 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesUTRN (0bp away)
ANODEV p-value1.1307245583e-06
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
38383 UTRN 25171 uc003qkt.3 chr6 144612873 145174170 + 200 100.0 0.67 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (0), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0) 0.0
38383 UTRN 25171 uc010khq.1 chr6 144607490 144801118 + 200 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
38383 chr6 144652721 144653195 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 56 score:832, srow:1054011
38383 chr6 144652775 144653098 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SP1 score:201, expCount:1, expNums:153, expScores:201, srow:3647730
38383 chr6 144652837 144653072 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RAD21 score:162, expCount:1, expNums:466, expScores:162, srow:3647731
38383 chr6 144652870 144653119 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TEAD4 score:449, expCount:1, expNums:160, expScores:449, srow:3647732
  • 4 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
38383 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 0
38383 cellexp id=ENSG00000152818, name=UTRN, PrEC=4322, str=4811, LNCaP=10849, str=16469, DU145=8984, str=9102
38383 cellexp id=ENSG00000225311, name=RP1-91J24.3, PrEC=0, str=0, LNCaP=0, str=0, DU145=0, str=0
38383 tcgaexp gene=UTRN, entrez=7402, pos=chr6:144607490-145174170(+), B=11905, L=17513, M=16902, H=17516
38383 pubmed gene=UTRN, G=269, GP=1, GC=10, GM=1, GPM=0, GCM=1