DMR 38421 chr6:166884101-166884550 (450bp)

DMR Stats
Positionchr6:166884101-166884550 (View on UCSC)
Width450bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRPS6KA2 (0bp away)
ANODEV p-value0.000181679002868
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 1.0 (16.67%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
38421 RPS6KA2 25316 uc003qvb.1 chr6 166822854 167040726 - 450 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
38421 RPS6KA2 25316 uc003qvc.1 chr6 166822854 167275771 - 450 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
38421 RPS6KA2 25316 uc003qvd.1 chr6 166822854 167275771 - 450 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
38421 RPS6KA2 25316 uc010kkl.1 chr6 166822854 166958171 - 450 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
38421 RPS6KA2 25316 uc011ego.1 chr6 166822854 166955938 - 450 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
38421 chr6 166883686 166884255 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 16 score:1000, srow:1065073
38421 chr6 166884306 166884935 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 17 score:256, srow:1065074
38421 chr6 166884338 166884353 tfbsConsSites V$S8_01 score:854, zScore:1.75, srow:4663242
38421 chr6 166884388 166884393 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:8048152
  • 4 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
38421 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 3, DU145: 6
38421 cellexp id=ENSG00000071242, name=RPS6KA2, PrEC=3181, str=492, LNCaP=5779, str=2582, DU145=8333, str=6629
38421 tcgaexp gene=RPS6KA2, entrez=6196, pos=chr6:166822854-167275771(-), B=4180, L=4229, M=4376, H=3985
38421 pubmed gene=RPS6KA2, G=18, GP=1, GC=12, GM=1, GPM=0, GCM=1