DMR 38455 chr7:641651-641800 (150bp)

DMR Stats
Positionchr7:641651-641800 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesPRKAR1B (0bp away)
ANODEV p-value0.00330943435815
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
38455 PRKAR1B 26577 uc003siu.2 chr7 588834 752161 - 150 100.0 1.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
38455 PRKAR1B 26577 uc003siv.3 chr7 588834 752844 - 150 100.0 1.82 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
38455 PRKAR1B 26577 uc003siw.2 chr7 588834 767313 - 150 100.0 1.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
38455 PRKAR1B 26577 uc021zyi.1 chr7 588834 752577 - 150 100.0 1.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
38455 PRKAR1B 26577 uc021zyj.1 chr7 588834 766978 - 150 100.0 1.71 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
38455 PRKAR1B 26577 uc021zyk.1 chr7 588834 767313 - 150 100.0 1.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
38455 PRKAR1B 26577 uc031swi.1 chr7 588834 731428 - 150 100.0 1.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
38455 chr7 641166 642630 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 68 score:1000, srow:1069415
38455 chr7 641075 641670 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NFIC score:329, expCount:1, expNums:97, expScores:329, srow:3692053
38455 chr7 641120 642744 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:773, expCount:17, expNums:32,104,105,130,131,229,306,308,328,330,332,334,336,338,340,522,583, expScores:187,438,582,304,454,384,276,229,187,159,240,221,440,174,219,249,339, srow:3692054
38455 chr7 641150 641685 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SIN3A score:192, expCount:1, expNums:312, expScores:192, srow:3692055
38455 chr7 641170 641860 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RELA score:459, expCount:4, expNums:325,327,335,339, expScores:459,127,216,225, srow:3692056
38455 chr7 641220 641655 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAX score:276, expCount:1, expNums:296, expScores:276, srow:3692063
38455 chr7 641234 641848 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TBP score:143, expCount:1, expNums:317, expScores:137, srow:3692066
38455 chr7 641502 641781 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 JUND score:223, expCount:1, expNums:507, expScores:223, srow:3692081
38455 chr7 641504 641799 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 JUN score:117, expCount:1, expNums:458, expScores:117, srow:3692082
38455 chr7 641709 641968 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TCF12 score:130, expCount:1, expNums:116, expScores:130, srow:3692083
38455 chr7 640182 642181 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:36178
  • 11 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
38455 cellmeth_recounts PrEC: 9, LNCaP: 5, DU145: 17
38455 cellexp id=ENSG00000188191, name=PRKAR1B, PrEC=2378, str=1278, LNCaP=1796, str=960, DU145=1708, str=1583
38455 tcgaexp gene=PRKAR1B, entrez=5575, pos=chr7:588834-767313(-), B=1136, L=1002, M=985, H=890