DMR 38597 chr7:51226001-51226150 (150bp)

DMR Stats
Positionchr7:51226001-51226150 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCOBL (0bp away)
ANODEV p-value0.0456124643121
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
38597 COBL 26992 uc003tpp.4 chr7 51083909 51258775 - 150 100.0 2.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
38597 COBL 26992 uc003tpq.4 chr7 51083909 51261286 - 150 100.0 2.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
38597 COBL 26992 uc003tpr.4 chr7 51083909 51384515 - 150 100.0 2.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
38597 COBL 26992 uc003tps.3 chr7 51083909 51384515 - 150 100.0 2.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
38597 COBL 26992 uc003tpt.3 chr7 51138526 51384515 - 150 100.0 0.85 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
38597 COBL 26992 uc010kzc.3 chr7 51110933 51384515 - 150 100.0 0.85 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
38597 COBL 26992 uc011kcl.2 chr7 51083909 51384515 - 150 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
38597 chr7 51226001 51226275 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:117, srow:1094561
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
38597 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 9, DU145: 0
38597 cellexp id=ENSG00000106078, name=COBL, PrEC=21, str=124, LNCaP=3526, str=2875, DU145=4090, str=3472
38597 tcgaexp gene=COBL, entrez=23242, pos=chr7:51083909-51384515(-), B=3839, L=5040, M=5006, H=4972