DMR 38916 chr8:28203951-28204300 (350bp)

DMR Stats
Positionchr8:28203951-28204300 (View on UCSC)
Width350bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesZNF395 (0bp away)
ANODEV p-value0.00766932773597
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
38916 ZNF395 28342 uc003xgq.3 chr8 28203102 28243590 - 350 100.0 0.87 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100) 43.14
38916 ZNF395 28342 uc003xgr.3 chr8 28203102 28243977 - 350 100.0 0.79 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100) 43.14
38916 ZNF395 28342 uc003xgs.3 chr8 28203102 28243977 - 350 100.0 0.34 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100) 43.14
38916 ZNF395 28342 uc003xgt.4 chr8 28203102 28347835 - 350 100.0 0.45 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (100) 43.14
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
38916 chr8 28204246 28204450 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 3 score:167, srow:1150649
38916 chr8 28204107 28204110 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:8768897
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
38916 cellmeth_recounts PrEC: 4, LNCaP: 4, DU145: 3
38916 cellexp id=ENSG00000186918, name=ZNF395, PrEC=3013, str=1864, LNCaP=1279, str=1272, DU145=3015, str=2426
38916 tcgaexp gene=ZNF395, entrez=55893, pos=chr8:28203102-28347835(-), B=5705, L=4834, M=4778, H=4107