DMR 39253 chr9:36986751-36986900 (150bp)

DMR Stats
Positionchr9:36986751-36986900 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPAX5 (0bp away)
ANODEV p-value0.000102125991646
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
39253 PAX5 29391 uc003zzo.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc010mlo.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc010mlp.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc010mlq.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.08 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc010mlr.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc010mls.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lpt.1 chr9 36838531 37002773 - 150 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lpu.1 chr9 36838531 37002773 - 150 100.0 0.08 1 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lpv.1 chr9 36838531 37002773 - 150 100.0 0.36 1 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lpw.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.36 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lpx.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.27 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lpy.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lpz.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lqa.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lqb.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.19 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
39253 PAX5 29391 uc011lqc.1 chr9 36838531 37034476 - 150 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
  • 16 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
39253 chr9 36986606 36988315 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 59 score:672, srow:1210030
39253 chr9 36985423 36987609 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EZH2 score:906, expCount:9, expNums:6,15,17,19,21,36,38,40,43, expScores:317,391,185,153,350,306,234,284,278, srow:4148803
39253 chr9 36986094 36986903 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SUZ12 score:204, expCount:1, expNums:578, expScores:204, srow:4148807
39253 chr9 36840557 37020798 cosmic COSM87165 srow:1190754
39253 chr9 36846840 37002773 cosmic COSM87207 srow:1190761
39253 chr9 36882001 37034028 cosmic COSM87159 srow:1190775
39253 chr9 36882001 37020798 cosmic COSM87060 srow:1190778
39253 chr9 36923352 37020798 cosmic COSM87149 srow:1190794
39253 chr9 36966546 37034028 cosmic COSM87053 srow:1190806
39253 chr9 36966546 37034028 cosmic COSM87157 srow:1190807
39253 chr9 36966546 37020798 cosmic COSM87061 srow:1190808
39253 chr9 36966546 37034028 cosmic COSM87205 srow:1190809
39253 chr9 36985987 36986924 cpgIsland CpG: 76 length:938, cpgNum:76, gcNum:498, perCpg:16.2, perGc:53.1, obsExp:1.16, srow:26495
  • 13 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
39253 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 519, DU145: 4
39253 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=53, B=1550, Length=2060, Event=Up, log2FC=4.87, padj=0
39253 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=1662.36, B=23.39, Length=2180, Event=Down, log2FC=-6.15, padj=0
39253 cellexp id=ENSG00000196092, name=PAX5, PrEC=5, str=43, LNCaP=2, str=2, DU145=6, str=6
39253 tcgaexp gene=PAX5, entrez=5079, pos=chr9:36838531-37034476(-), B=22, L=33, M=34, H=50
39253 pubmed gene=PAX5, G=961, GP=0, GC=486, GM=56, GPM=0, GCM=33