DMR 39842 chr11:502001-502150 (150bp)

DMR Stats
Positionchr11:502001-502150 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesRNH1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00672348371399
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
39842 RNH1 4085 uc001lpk.1 chr11 494512 503570 - 150 100.0 1.46 0 0.0 E1 (59.33), I1 (40.67), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lpl.1 chr11 494512 506821 - 150 100.0 6.22 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (59.33), I3 (40.67), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lpm.1 chr11 494512 506821 - 150 100.0 0.87 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (59.33), I2 (40.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lpn.1 chr11 494512 506821 - 150 100.0 1.74 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (59.33), I3 (40.67), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lpo.1 chr11 494512 506821 - 150 100.0 0.86 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (59.33), I2 (40.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lpp.2 chr11 494512 507283 - 150 100.0 0.86 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (59.33), I3 (40.67), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lpq.2 chr11 494512 507283 - 150 100.0 0.65 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (59.33), I2 (40.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lpr.2 chr11 494512 507283 - 150 100.0 0.65 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (59.33), I3 (40.67), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc001lps.2 chr11 494512 507283 - 150 100.0 0.86 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (59.33), I2 (40.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
39842 RNH1 4085 uc009ybx.2 chr11 499897 507283 - 150 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (59.33), I3 (40.67), E4 (0) 0.0
  • 10 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
39842 chr11 502046 502755 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 9 score:470, srow:184936
39842 chr11 502086 502107 tfbsConsSites V$HEN1_02 score:750, zScore:1.66, srow:768302
39842 chr11 502116 502125 tfbsConsSites V$AP4_Q6 score:939, zScore:1.69, srow:768303
39842 chr11 502130 502144 cosmic COSM927774 srow:179709
39842 chr11 502136 502136 cosmic COSM1475502 srow:179710
39842 chr11 502059 502065 phastConsElements100way lod=34 score:343, srow:1313128
39842 chr11 502077 502084 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:1313129
39842 chr11 502089 502099 phastConsElements100way lod=35 score:345, srow:1313130
39842 chr11 502103 502105 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:1313131
39842 chr11 502116 502120 phastConsElements100way lod=20 score:290, srow:1313132
39842 chr11 500190 502189 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:5824
  • 11 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
39842 cellmeth_recounts PrEC: 23, LNCaP: 30, DU145: 1
39842 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=164, B=7, Length=1080, Event=Down, log2FC=-4.55, padj=0
39842 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=111.18, B=8.42, Length=980, Event=Down, log2FC=-3.72, padj=0
39842 cellexp id=ENSG00000023191, name=RNH1, PrEC=14006, str=7825, LNCaP=7501, str=4589, DU145=9041, str=6955
39842 tcgaexp gene=RNH1, entrez=6050, pos=chr11:494512-507283(-), B=10784, L=10601, M=9595, H=8830