DMR 39849 chr11:974851-975000 (150bp)

DMR Stats
Positionchr11:974851-975000 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesAP2A2 (0bp away)
ANODEV p-value0.0153492905511
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
39849 AP2A2 4122 uc001lss.3 chr11 925809 1012245 + 150 100.0 0.82 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
39849 AP2A2 4122 uc001lst.2 chr11 925809 1012245 + 150 100.0 1.68 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
39849 AP2A2 4122 uc001lsu.1 chr11 972062 982781 + 150 100.0 1.01 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0) 0.0
39849 AP2A2 4122 uc009yco.2 chr11 925809 1006617 + 150 100.0 0.9 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
39849 chr11 974949 975537 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:311, expCount:2, expNums:123,124, expScores:311,246, srow:642548
39849 chr11 973212 975211 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:6778
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
39849 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 14, DU145: 29
39849 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=2, B=21, Length=220, Event=Up, log2FC=3.39, padj=0.000873494998786926
39849 cellexp id=ENSG00000183020, name=AP2A2, PrEC=6767, str=5972, LNCaP=9203, str=6154, DU145=4767, str=3691
39849 tcgaexp gene=AP2A2, entrez=161, pos=chr11:925809-1012245(+), B=5031, L=6289, M=5700, H=5408